Научный архив: статьи

Введение. Нижнее Поволжье, в том числе Волгоградская область, вплоть до настоящего времени относится к числу наиболее неблагополучных по бешенству регионов России. Сведения о генетическом разнообразии возбудителя бешенства в современный период для Волгоградской области представлены недостаточно, поэтому филогенетический анализ изолятов вируса бешенства из этого региона представляется актуальной научной задачей.

Цель исследования. Проведение филогенетического анализа современных изолятов вируса бешенства, выделенных от животных на территории Волгоградской области, на основании полноразмерной последовательности гена нуклеопротеина.

Материалы и методы. Использовали головной мозг животных с диагнозом «бешенство». Анализ полученных нуклеотидных последовательностей гена нуклеопротеина вируса бешенства проводили с помощью байесовского метода строгих молекулярных часов. Ландшафтно-географическая карта Natural Earth использована для описания пространственного распределения изолятов возбудителя бешенства.

Результаты. Определена полноразмерная последовательность гена нуклеопротеина 13 изолятов вируса бешенства из Волгоградской области. Филогенетический анализ позволил установить, что представители популяции возбудителя бешенства из этого региона относятся к различным генетическим вариантам группы С, сформировавшимся в разное время. Генетическое родство с изолятами из Казахстана, Молдовы, центральных и южных регионов России, с Украины свидетельствует об интенсивном перемещении вируса бешенства на юге европейской части России. В то же время разные варианты вируса бешенства обнаружены на левом и правом берегах Волги.

Заключение. Все изученные изоляты возбудителя бешенства из Волгоградской области принадлежали к генетической группе С и отличались высоким генетическим разнообразием вариантов.

Введение. На территории Российской Федерации регистрируются эпизоотии бешенства природного типа, которые характеризуются стабильно высокой инцидентностью среди диких и домашних животных. Непрерывность эпизоотического процесса бешенства обеспечивается биологической резервацией вируса Lyssavirus rabies в популяциях диких хищников семейства псовых, преимущественно в популяции рыжей лисицы (Vulpes vulpes). Экология и этология лисиц предопределяют территорию распространения бешенства, сезонную динамику инцидентности и видовой состав животных, вовлекаемых в эпизоотический процесс.
Цель исследования. Проведение пространственно-временного анализа данных мониторинга бешенства за 35-летний период для исследования факторов, определяющих особенности современной эпизоотической ситуации.

Материалы и методы. На платформе реляционной системы управления базами данных Microsoft Access (www. microsoft. com) были агрегированы данные о вспышках бешенства на территории Российской Федерации, о проведении антирабической вакцинации среди диких животных, а также о природно-сельскохозяйственном районировании. Для выполнения пространственного анализа вся эпизоотологическая информация базы данных была геокодирована и представлена в виде наборов векторных карт в тематическом проекте геоинформационной системы. Построение ГИС-проекта проводилось на платформе QGIS Desktop (www. qgis. org).

Результаты. Современный нозоареал бешенства охватывает территорию, которая затрагивает большую часть регионов Российской Федерации. Основная зона стабильно высокой инцидентности бешенства приходится на биомы лесостепей, смешанных и широколиственных лесов Восточно-Европейской равнины. На территории Российской Федерации максимальное количество случаев бешенства регистрируется среди лисиц. Эпизоотии бешенства в природных экосистемах сопровождаются эффектом «перелива» (spillover effect) с активным распространением болезни среди различных видов домашних животных. Основную группу эпизоотологического риска составляют собаки, кошки и крупный рогатый скот. Оральная антирабическая вакцинация диких хищников обеспечила формирование выраженного тренда на снижение заболеваемости животных бешенством с одновременным уменьшением амплитуды колебаний кривой инцидентности в периоды многолетних эпизоотических циклов.

Заключение. Регистрируемое снижение инцидентности бешенства на территории Российской Федерации не сопровождается значимым уменьшением площади нозоареала. Это свидетельствует о необходимости коррекции проводимых противоэпизоотических мероприятий с разработкой программы по обеспечению полной элиминации циркулирующих полевых штаммов Lyssavirus rabies из неблагополучных экосистем.

Введение. На современном этапе бешенство продолжает оставаться одним из самых опасных инфекционных заболеваний зоонозной природы. Республика Беларусь является неблагополучной по бешенству животных, при этом заболевание регистрируется во всех регионах страны.

Цель исследования. Целью работы являлись оценка эпизоотической ситуации по бешенству в республике и обобщение современных подходов к диагностике и профилактике заболевания.

Результаты. Приведены актуальные данные об эпизоотической и эпидемиологической ситуации по бешенству в Республике Беларусь. Бешенство на территории республики протекает в виде эпизоотии природного типа, в которую она была вовлечена совместно с граничащими государствами (Польша, Литва, Латвия, Украина, Россия). Чаще всего резервуаром вируса бешенства являются дикие плотоядные животные (70% от всех зарегистрированных случаев): лисицы, енотовидные собаки и волки. На втором месте – домашние плотоядные (кошки, собаки), в единичных случаях – сельскохозяйственные животные. В статье описаны основные направления работы ветеринарной и санитарно-эпидемиологической службы Республики Беларусь, включая специфическую профилактику бешенства среди домашних плотоядных животных, оральную антирабическую вакцинацию диких плотоядных животных и информационную работу с населением, приводятся исторические и современные данные о вакцинации и ее эффективности, представлены основные стратегические направления Комплексного плана профилактики бешенства на 2021–2025 гг., приведены данные об эффективности отдельных мероприятий плана.

Заключение. В Республике Беларусь проблема бешенства остается актуальной, в первую очередь она касается дикой фауны. Основополагающими методами борьбы с заболеванием являются оральная антирабическая вакцинация диких животных и информационная работа с населением. Для стойкого уменьшения количества случаев бешенства в дикой и домашней фауне, а также для снижения рисков заболевания людей считаем необходимым дальнейшее расширение площадей оральной антирабической вакцинации, а также усиление контроля и интенсивности программы антирабической вакцинации домашних плотоядных животных.

Бешенство – широко распространенное инфекционное заболевание млекопитающих животных, в том числе человека. Заболевание проявляется нарушением функции центральной нервной системы. Эпизоотическая ситуация по бешенству в мире остается напряженной, не отличается ситуация и в странах СНГ. Для достижения стойкого благополучия по бешенству необходим комплексный подход. Решением Межправительственного совета по сотрудничеству в области ветеринарии Содружества Независимых Государств от 12 мая 2016 г. ФГБУ «ВНИИЗЖ» было поручено подготовить проект Комплекса совместных действий государств – участников СНГ по профилактике и борьбе с бешенством на период до 2025 г. Комплекс был разработан и утвержден решением Совета глав правительств СНГ от 1 июня 2018 г. В статье подводятся итоги реализации Комплекса совместных действий до 2025 г. и освещается разработка Комплекса совместных действий на 2025–2030 гг., основной целью которого является минимизация риска распространения очагов бешенства на территории государств – участников СНГ.

Цель статьи: на основе результатов изучения опыта взаимодействия научных библиотек Сибири и Дальнего Востока в XX – первых десятилетиях XXI в. определить тенденции развития библиотек, цель и задачи Государственной публичной научно-технической библиотеки Сибирского отделения Российской академии наук (ГПНТБ СО РАН) при разработке проекта по развитию многоотраслевых научных библиотек, библиотек учреждений науки и вузов региона в 2025– 2030 гг. в соответствии с приоритетными направлениями государственной научно-технологической, социально-культурной политики Российской Федерации.

Представлены краткая история и динамика формирования сети библиотек учреждений науки и вузов, отраслевых и многоотраслевых библиотек в регионе – важной составной части информационного обеспечения специалистов научно-образовательного и производственного комплексов. Рассмотрена роль ГПНТБ Сибирского отделения Академии наук (СО АН) СССР – и позднее СО РАН – ведущей многоотраслевой научно-технической библиотеки, информационно-методического центра для академических библиотек, в 1960–1990-е гг. являвшейся также координационным центром для библиотек учреждений науки, крупнейших вузов, отраслевых и центральных научных библиотек областей, краев и республик региона.

В связи с принятием ряда законодательных актов в 2013–2024 гг., трансформацией деятельности научных библиотек обосновывается необходимость разработки и реализации проекта по развитию многоотраслевых научных библиотек, библиотек учреждений науки и вузов Сибири и Дальнего Востока.

Статья посвящена юбилею профессионального журнала «Вестник Национальной библиотеки Республики Саха (Якутия). Журнал, созданный в 2003 г., стал профессиональной площадкой для библиотечного сообщества Якутии. Анализируются этапы создания, содержание журнала и его региональная специфика. Определена главная цель Вестника – публикация современных передовых практик библиотечно-информационной деятельности, вопросов развития библиотековедения, библиографии, книговедения, а также смежных наук, содействие развитию научной и информационной базы библиотек региона, укрепление имиджа и представительства в научном, академическом и профессиональном сообществе в России и за рубежом.

Цель. Изучить особенности микробного пейзажа у пациентов с хронической обструктивной болезнью легких и хроническим простым бронхитом профессиональной этиологии (ХОБЛ ПЭ и ХПБ ПЭ) от воздействия минеральной пыли с различными клиническими фенотипами.

Материалы и методы. В зависимости от частоты обострений и показателя спирометрии пациенты были разделены на 3 группы: клинический фенотип «В» (ХОБЛ ПЭ, GOLD II) – 10 человек; клинический фенотип «Е» (ХОБЛ ПЭ, GOLD III-IV) – 19 человек; ХПБ ПЭ – 11 человек. В соответствии с методическими указаниями осуществлялся забор слизи из лакун миндалин, далее биоматериал транспортировался в лабораторию в изотермических условиях с использованием транспортной среды Эймса. Посев осуществлялся на плотные питательные среды, которые инкубировались в аэробных и микроаэрофильных условиях. Идентификацию выросших культур проводили с использованием метода MALDI-ToF масс-спектрометрии. Антибиотикорезистеность выделенных микроорганизмов определяли диско-диффузионным методом в соответствии с актуальной версией рекомендаций МАКМАХ.

Результаты. Общими характеристиками микробиоты у пациентов ХОБЛ ПЭ обоих фенотипов были: преобладание представителей Firmicutes, равная бактериальная нагрузка (р = 0,48), отсутствие протективных комменсалов и типичных для больных ХОБЛ микроорганизмов (Moraxella catarrhalis). Streptococcus pneumoniae и Haemophilus influenzae встретились только у одного пациента фенотипа «Е». Фенотип ХОБЛ ПЭ «Е» качественно отличался от фенотипа «В» за счет преобладания представителей Pseudomonadota (р = 0,0005), условно-патогенных микроорганизмов над непатогенными (54% против 19%, р = 0,0005), меньшим количеством представителей Neisseriales, большим количеством устойчивых к антибиотикам микроорганизмов и большим количеством грибов рода Candida.

Выводы. Результаты исследования указывают на гетерогенность микробиоты у различных клинических фенотипов пациентов ХОБЛ ПЭ и ХПБ ПЭ. Общими чертами всех фенотипов стала тенденция к росту условно-патогенной микробиоты, наличие устойчивых к антибиотикам изолятов. Пациенты с частыми обострениями имели эндотип Т2 воспаления, у них отмечалось более выраженное упрощение микробиоты, рост представителей условно-патогенной микробиоты, устойчивой к антибиотикам. Нарушения в микробиоте у пациентов с ХПБ ПЭ говорят о вовлечении микроорганизмов в процессы воспаления и ремоделирования дыхательных путей на раннем этапе заболевания, что требует дальнейших исследований. Полученные результаты необходимо учитывать при проведении эмпирической антибактериальной терапии обострений у этих больных, а также включении в реабилитационную программу пациентов ХОБЛ ПЭ и ХПБ ПЭ вакцинопрофилактики против пневмококка.

Цель. Провести анализ чувствительности стрептококков различных видов к антибактериальным препаратам в отделениях многопрофильного стационара. Материалы и методы. Проведено эпидемиологическое наблюдательное описательное сплошное ретроспективное исследование. Проанализированы данные чувствительности к антибиотикам 2916 изолятов стрептококков, вне зависимости от их клинической значимости, полученных из лабораторной информационной системы «АЛИСА» ГКБ №67 им. Л. А. Ворохобова ДЗМ за период с 01.01.2017 по 31.12.2022. Исследование чувствительности стрептококков к антибиотикам проводили методом микроразведений на микробиологическом анализаторе BD Phoenix M50 в соответствии с рекомендациями EUCAST (v.2.1-v12.0, в зависимости от года тестирования изолята). Статистическую обработку с использованием программ Microsoft Excel 2010 и IBM SPSS Statistics22.

Результаты. Видовой состав выделенных стрептококков различался в зависимости от отделения. В отделении гнойной хирургии за анализируемый период чаще выделялись: S. pyogenes (28,5%), S. agalactiae (22,0%), S. anginosus (16,5%); в отделении колопроктологии – S. anginosus (41,7%), S. constellatus (16,0%), S. agalactiae (14,5%); в хирургическом отделении – S. anginosus (40,1%) и S. constellatus (31,4%); в реанимационном отделении – S. anginosus (21,8%), S. constellatus (11,3%), S. oralis (11,1%); в гинекологическом отделении – S. agalactiae (49,9%) и S. anginosus (31,3%). Значительная доля культур S. agalactiae проявляла резистентность к тетрациклину и клиндамицину во всех отделениях больницы. В отделении гнойной хирургии с 2019 г. по 2021 г. был отмечен рост устойчивости S. agalactiae к эритромицину с 15,4% до 38,3%, а в отделении колопроктологии – с 16,7% до 38,5%; также возросла устойчивость и к клиндамицину с 2018 г. по 2020 г, в гнойной хирургии с 24,2% до 71,3%, в колопроктологии – с 13,6 до 70,7%, в гинекологии – с 20,0 до 90,3%. В реанимационном отделении S. agalactiae и S. pyogenes были наиболее устойчивы к тетрациклину (79,5% и 51,3%), эритромицину (32,8% и 31,7%) и триметоприму-сульфаметоксазолу (18,5% и 26,8%). S. pneumoniae проявлял наибольший уровень резистентности к действию эритромицина (35,3%), клиндамицина (29,3%) и триметоприма-сульфаметоксазола (26,0%).

Выводы. Выявлен рост устойчивости к антимикробным препаратам у наиболее часто встречающихся видов стрептококков. Обнаружена неодинаковая чувствительность к антибиотикам стрептококков одного и того же вида в различных отделениях стационара. Отмечена тенденция к увеличению распространенности полирезистентных штаммов S. pyogenes и S. agalactiae в реанимационном и гнойно-хирургическом отделениях.

Цель. Изучить микробный состав биоптатов при воспалительных заболеваниях кишечника.

Материалы и методы. С ноября 2019 по февраль 2023 г. обследовано 100 пациентов колопроктологического отделения с воспалительными заболеваниями кишечника (ВЗК): 65 пациентов – с язвенным колитом и 35 пациентов с болезнью Крона. Осуществлен метагеномный анализ биоптатов (ДНК-секвенатор Illumina, США), полученных в ходе эндоскопического исследования по стандартной методике, с биоиформатическим анализом данных. Разнообразие микробиомов в образцах (альфа-разнообразие) оценивали с помощью индекса Фишера. С помощью расстояния Брея-Кертиса оценивали сходство микробиомов между образцами (бета-разнообразие). Проведен анализ главных координат (PCoA) для визуализации сходства микробиомов между образцами. Статистически значимыми считали результаты при p < 0,05.

Результаты. Метагеномный анализ позволил изучить качественный и количественный состав микробиоты кишечника у пациентов с язвенным колитом и болезнью Крона. Выявлено 20 филумов микроорганизмов, в том числе 146 семейств, 336 родов, 516 видов микроорганизмов. На уровне филумов было получено два основных – Proteobacteria, Firmicutes. При сравнии изучаемые нозологические формы между собой было отмечено увеличение разнообразия бактерий филума Proteobacteria в 1,2 раза при язвенном колите. Преобладающим видом данного филума является Escherichia сoli. В свою очередь, относительная представленность кишечной палочки выше в 1,6 раз у пациентов с болезнью Крона (23,9%/14,48%). Выявлены таксономические категории, отсутствующие при том или ином виде заболевания – отделы: Cyanobacteria (0,049%), Acidobacteria (0,010), Planctomycetes (0,009%), некультивируемые бактерии-кандидаты в подразделении SR1 (Sulfur-River 1) (0,007%), Synergistetes (0,007%), Chloroflexi (0,004%), Lentisphaerae (0,002%), бактерии-кандидаты типа OD1 (Parcubacteria) (0,001%), Spirochaetes (0,001%), род Helicobacter (5%) выявлены только у пациентов с язвенным колитом; отдел Gemmatimonadetes (0,009%) – только при болезни Крона.

Выводы. Идентификация кишечных микроорганизмов, ассоциированных с патогенезом воспалительных заболеваний кишечника, является крайне важным аспектом для глубокого понимания различных патогенных факторов, имеющих большое значение для раннего выявления ВЗК.

Цель. Описать фенотипические и геномные характеристики феномена изменения уровня чувствительности к азтреонаму у клинического изолята Pseudomonas aeruginosa при формировании резистентности к колистину в условиях эволюционного эксперимента.

Материалы и методы. Объектом исследования был клинический изолят P. aeruginosa с фенотипом множественной антибиотикорезистентности. Исследование проводили на основе пространственно-временной модели формирования резистентности подвижных бактерий в возрастающей концентрации колистина. Эксперимент продолжался в течение 44 суток. По мере появления роста бактерий в зонах с повышающейся концентрацией колистина, с фронта распространения P. aeruginosa отбирали образцы в точках опережающего роста. У отобранных изолятов определяли уровни чувствительности к антибиотикам и выявляли геномные изменения.

Результаты. У исходного изолята МПК азтреонама составляла 4 мг/л, что соответствовало критерию EUCAST «чувствительный при увеличенной экспозиции» Из 74 изолятов P. aeruginosa, отобранных в ходе эксперименты, было отобрано 11 изолятов с изменившейся чувствительностью к азтреонаму. У 6 из 11 отобранных изолятов чувствительность к азтреонаму повысилась, у 5 изолятов усилилась резистентность. Генетические детерминанты резистентности, присутствующие в исходном штамме, не изменились. Изоляты, у которых восстановилась чувствительность к азтреонаму, имели набор мутаций, включающих повреждение генов pmrB (del-18bp-298-315) и davD (TGA1450- 1452→CTC). Изоляты, у которых МПК азтреонама увеличилась в 4 раза, несли различные мутационные профили. Изолят с максимальной устойчивостью к азтреонаму (МПК = 32 мг/л) имел мутацию в гене capD (del-T-360) и большую делецию 262 402 bp (239 ORF). Мутации, появлявшиеся в генах phoQ, lpxL_2, wecA, mexB, spaQ, pcpR и rpoA, не оказывали значительного влияния на уровень чувствительности к азтреонаму.

Выводы. Полученные результаты внесли вклад в понимание направлений генно-инженерного моделирования, направленного на расширение представлений о механизмах устойчивости к азтреонаму.

Цель. Определение молекулярно-биологических характеристик штаммов Candida albicans, выделенных при рецидивирующем вульвовагинальном кандидозе (РВВК), ассоциированных с формированием резистентности к препаратам азолового ряда.

Материалы и методы. В исследование было включено 36 клинических изолятов C. albicans от больных РВВК, обратившихся в НИИ медицинской микологии им. П. Н. Кашкина за амбулаторной помощью с июля по ноябрь 2024 г. Видовую идентификацию Candida spp. проводили методами MALDI-TOF масс-спектрометрии и таргетного секвенирования. Чувствительность Candida spp. к противогрибковым лекарственным средствам (ПГЛС) определяли с помощью тест системы Fungus AST (Autobio Diagnostics Co, Китай) с интерпретацией пороговых значений МПК в соответствии с CLSI M27A, 2022. Нуклеотидную последовательность гена ERG11 изучали методом таргетного секвенирования на генетическом анализаторе ABI PRISM 3500. Уровень экспрессии генов белков-транспортеров лекарственных препаратов CDR1, CDR2, MDR1 и FLU1 анализировали в ходе ПЦР-РВ с использованием флуоресцентного красителя EVA Green методом относительных измерений 2-ΔΔСt. Биопленкообразование штаммов C. albicans оценивали по общей клеточной массе (окрашивание водным раствором кристаллического фиолетового) и метаболической активности клеток (метод восстановления солей тетразолия). Статистическую обработку результатов проводили с использованием непараметрических критериев оценки программы SPSS v.22.0.

Результаты. 11 (30,5%) штаммов были чувствительны к флуконазолу, 6 (14,0%) – отнесены к категории «чувствительный дозо-зависимый», 20 (55,5%) – резистентны к данному ПГЛС. Все штаммы были чувствительны к полиенам, эхинокандинам и 5-флуцитозину. В работе показана корреляция между нуклеотидным полиморфизмом гена ERG11 и чувствительностью штамма к флуконазолу. Резистентные штаммы C. albicans (МПК >8 мг/л) отличались наименьшей вариабельностью и наличием в генотипе единственной миссенс-мутации T394C (Y132H), ассоциированной с устойчивостью к азолам. Предположена возможная роль A1343G (E448G), как супрессорной внутригенной мутации, нивелирующей влияние T394C (Y132H) на конформационные изменения белка Erg11. В данном аспекте необходимы дальнейшие исследования. Для генов ERG11 и FLU1 показан повышенный уровень экспрессии (р = 0,004 и р = 0,012 соответственно) у нечувствительных к флуконазолу штаммов C. albicans по сравнению с чувствительными. Статистически значимых различий в экспрессии генов белков-транспортеров лекарственных препаратов CDR1, CDR2 и MDR1 не установлено. Все изученные штаммы C. albicans образовывали биопленки in vitro. Штаммы, резистентные к флуконазолу, обладали большей метаболической активностью и клеточной массой биопленки (p = 0,011 и р = 0,012 соответственно).

Выводы. Резистентность возбудителей РВВК в Северо-Западном регионе России ассоциирована с повышенным биопленкообразованием, аминокислотной заменой Y132H и повышенным уровнем экспрессии генов ERG11 и FLU1.

Цель. Разработать модель количественной оценки экономических потерь, обусловленных нерациональным применением антимикробных препаратов и недостаточной точностью микробиологической диагностики антимикробной резистентности.

Материалы и методы. Для формирования стартовых параметров модели было проведено анкетирование по особенностям практики антимикробной терапии, значении микробиологических заключений с оценкой частоты ошибок и их последствий. Основа модели представляет взаимосвязь между точностью микробиологического заключения, вероятностью нерациональной антимикробной терапии и экономическим ущербом. С целью повышения точности и адаптивности модели были включены параметры валового регионального продукта, численность населения, структура ключевых возбудителей внебольничных и нозокомиальных инфекций, частота различных фенотипов, а также цены на антимикробные препараты.

Результаты. Бактериальные инфекции встречаются на регулярной основе в практике более 75% специалистов. В наибольшем проценте случаев на запрос консультации клинического фармаколога по вопросам терапии инфекций влияет множественная лекарственная устойчивость патогенов и неэффективность назначенной терапии. Электронное микробиологическое заключение получают 50,85% специалистов, а 65,62% – результаты из внутренней лаборатории. Однако 36% специалистов не имеют доступа к консультации специалистов лабораторной службы. Наличие связи между интерпретацией антибиотикограммы и выбором антимикробной терапии отметили 82,32% специалистов. На амбулаторном этапе легкие и умеренные последствия некорректной антимикробной терапии (АМТ) с частотой до 25% наблюдают 25,6% и 79,85% специалистов соответственно. На стационарном этапе умеренные и тяжелые последствия АМТ (частота более 25%) регистрируют 34,83% и 19,52% специалистов. Согласно разработанной модели на 1000 пациентов, вероятности ошибки 10% и с учетом заданных параметров, прямые расходы на стационарном треке составляют более 1,7 млн рублей, а общие потери достигают 18,94 млн рублей.

Выводы. Созданная экономическая модель позволяет оценить экономические последствия нерациональной антимикробной терапии, учитывая как прямые, так и косвенные затраты, и демонстрирует высокую адаптивность с учетом различных факторов. Полученные результаты подчеркивают необходимость дальнейших исследований для улучшения взаимодействия специалистов и разработки стратегий по снижению экономических потерь от антибиотикорезистентности.