Научный архив: статьи

Цель: анализ полиморфизма A/G в позиции 17:453356000 в гене TNS2, его ассоциации с фенотипическими показателями у радужной форели породы Рофор, а также исследование структуры размерно-весовых показателей исследуемой выборки.

Материалы и методы. Объект исследования – двухлетние самки радужной форели породы Рофор (n=200), от которых были получены морфометрические данные: масса тела, длина тела до конца хвостового плавника, длина тела до конца чешуйчатого покрова, длина головы, наибольшая высота и толщина тела. В исследовании применен метод генотипирования разработанной нами тест-системой и выполнена статистическая обработка данных в программной среде R с использованием библиотеки GGally и программной среде Python с инструментами анализа пакета scikit-learn.

Результаты. Успешно генотипированы самки маточного стада радужной форели породы Рофор (n=200) по замене A/G в позиции 17:453356000 гена TNS2. Подавляющее большинство особей оказалось носителем гетерозиготного генотипа AG (n=161). Проведённое исследование показало, что морфометрические признаки радужной форели имеют высокую взаимозависимость, а генотип GG ассоциируется с морфометрическими признаками, характеризующими более крупную конфигурацию тела у рыб. Настоящее исследование расширило имеющиеся знания в области генетики радужной форели. В результате проведения настоящего исследования была разработана тест-система для генотипирования замены A/G в экзонной части гена TNS2, которая может быть использована в программах маркер-ассоциированной селекции радужной форели.

Отрасль птицеводства, обеспечивающая население ценным белком животного происхождения, на сегодняшний день практически полностью зависит от закупки зарубежных кроссов. В связи с этим особое внимание необходимо уделить отечественному птицеводству и имеющимся генетическим ресурсам. Экстерьерная оценка является важным элементом в селекции, т. к. внешний вид позволяет судить о здоровье, породной принадлежности, предрасположенности к продуктивному использованию и приспособленности животного к условиям содержания. Тем не менее, темп селекции зависит от использования как фенотипических, так и генетических данных о животных. Особое внимание в последнее время уделяется GWAS-исследованиям - полногеномному поиску ассоциаций, который позволяет выявить участки генома, предположительно ответственные за проявление того или иного признака. Целью данного исследования было выявить генетические ассоциации с экстерьером у царскосельской породы кур. Для этого была проведена экстерьерная оценка птиц (n = 96), отбор крови и выделение ДНК, а также полногеномное генотипирование при помощи чипа средней плотности Illumina Chicken 60K SNP iSelectBeadChip (Illumina Inc., США). На основании данных полногеномного генотипирования было проведено GWAS-исследование и аннотирование кандидатных генов. В результате было получено 6 предположительно значимых SNP, ассоциированных с обхватом груди, длиной голени, длиной плюсны, а также с углом груди. Бо́льшая часть генов в идентифицированных локусах была вовлечена в процессы костеобразования и костного гомеостаза, которые косвенно регулируют биологический потенциал особи к росту. Выявленные гены-кандидаты могут быть рекомендованы к использованию в маркерной селекции для царскосельской породы кур. Для подтверждения фундаментальной роли выявленных генов в формировании генетического потенциала размерно-весовых характеристик необходимы исследования и на других породах птиц.