ПОЛИМОРФИЗМ ГЕНОВ TLR И ТЕЧЕНИЕ ДВУСТОРОННЕЙ ПНЕВМОНИИ ПРИ COVID-19 (2021)
COVID-19 — заболевание, течение которого зависит от ряда факторов, в том числе генетических, среди которых особый интерес представляют гены рецепторов врожденной иммунной системы — толл-подобные рецепторы (TLR), играющие центральную роль в развитии реакций врожденного иммунитета. Структура вируса SARS-CoV-2 включает, помимо нуклеокапсида, белково-липидную мембранную оболочку, что определяет
узнавание компонентов вируса разными TLR, в том числе и рецепторами подсемейства TLR2 (TLR1, 6, 10), генетические полиморфизмы генов которых встречаются с разной частотой в различных человеческих популяциях и не только влияют на функциональную активность системы врожденного иммунитета, но и определяют качество адаптивного иммунного ответа.
Цель исследования — определение ассоциации полиморфизмов генов толл-подобных рецепторов TLR1, TLR6 и TLR10 с тяжестью течения коронавирусной инфекции (COVID-19) в русской популяции Челябинской области.
Материалы и методы. В исследование вошли 86 пациентов из ковидных отделений больниц города Челябинска с диагнозом двусторонней пневмонии умеренной (У-ДСП, n = 36) или тяжелой (Т-ДСП, n = 50) степени тяжести. Контрольную группу составили 100 здоровых индивидов из регистра Челябинской областной станции переливания крови («Контроль»). Все исследованные индивиды принадлежали к русской этнической группе.
Полиморфизмы 1805T>G гена TLR1, 745C>T гена TLR6 и 721A>C гена TLR10 были определены с помощью полимеразной цепной реакции с полиморфизмом длин рестрикционных фрагментов. Ассоциации между генотипами и статусом индивидов проводили с помощью анализа соответствий и метода Монте-Карло.
Результаты. Выявлено, что различия между исследованными группами полностью определяются генотипами TLR1. Генотип GG статистически значимо чаще встречался в группе «Контроль» по сравнению с У-ДСП и Т-ДСП (p < 0,001, ОШ 12,94), его можно оценивать как протекторный в отношении развития двусторонней пневмонии на фоне COVID-19. Генотип TT можно рассматривать как предрасполагающий к развитию тяжелой
формы двусторон
Идентификаторы и классификаторы
Коронавирус SARS-CoV-2 очень быстро, через несколько месяцев после появления
в человеческой популяции, вызвал пандемию COVID-19, которая по скорости развития и негативным последствиям значительно превосходит все другие коронавирусные эпидемии, наблюдавшиеся в прошлом.
Список литературы
- WHO Coronavirus (COVID-19) Dashboard [Электронный ресурс]. Режим доступа: https://covid19.who.int/. Дата обращения: 29.11.2021.
- Pinheiro D.S., Santos R.S., Jardim P.C.B.V. et al. The combination of ACE I/D and ACE2 G8790A polymorphisms revels susceptibility to hypertension: A genetic association study in Brazilian patients // PLoS One. 2019. Vol. 14, No. 8. P. e0221248. DOI: 10.1371/journal.pone.0221248
- Gemmati D., Tisato V. Genetic hypothesis and pharmogenetics side of Renin-Angiotensin-System in COVID-19 // Genes (Basel). 2020. Vol. 11, No. 9. P. 1044. DOI: 10.3390/genes11091044
- Iwasaki A., Medzhitov R. Control of adaptive immunity by the innate immune system // Nat. Immunol. 2015. Vol. 16, No. 4. P. 343–353. DOI: 10.1038/ni.3123
- Beutler B., Jiang Z., Georgel P. et al. Genetic analysis of host resistance: toll-like receptor signaling and immunity at large // Annu. Rev. Immunol. 2006. Vol. 24. P. 353–389. DOI: 10.1146/annurev.immunol.24.021605.090552
- Mercier B.C., Cottalorda A., Coupet C.A. et al. TLR2 engagement on CD8 T cells enables generation of functional memory cells in response to a suboptimal TCR signal
// J. Immunol. 2009. Vol. 182, No. 4. P. 1860–1867. DOI: 10.4049/jimmunol.0801167 - Enard D., Depaulis F., Crollius H.R. Human and nonhuman primate genomes share hotspots of positive selection // PLoS Genet. 2010. Vol. 6, No. 2. P. e1000840.
DOI: 10.1371/journal.pgen.1000840 - Barreiro L.B., Quintana-Murci L. From evolutionary genetics to human immunology: how selection shapes host defense genes // Nat. Rev. Genet. 2010. Vol. 11, No. 1. P. 17–30.
DOI: 10.1038/nrg2698 - Casanova J.L., Abel L., Quintana-Murci L. HumanTLRs and IL-1Rs in host defense: natural insights from evolutionary, epidemiological, and clinical genetics
// Annu. Rev. Immunol. 2011. Vol. 29. P. 447–491. DOI: 10.1146/annurev-immunol-030409-101335 - Fumagalli M., Sironi M., Pozzoli U. et al. Signatures of environmental genetic adaptation pinpoint pathogens as the main selective pressure through human evolution // PLoS Genet. 2011. Vol. 7, No. 11. P. e1002355. DOI: 10.1371/journal.pgen.1002355
- Karlsson E.K., Kwiatkowski D.P., Sabeti P.C. Natural selection and infectious disease in human populations // Nat. Rev. Genet. 2014. Vol. 15, No. 6. P. 379–393. DOI: 10.1038/nrg3734
- Pickrell J.K., Coop G., Novembre J. et al. Signals of recent positive selection in a worldwide sample of human populations // Genome Res. 2009. Vol. 19, No. 5. P. 826–837.
DOI: 10.1101/gr.087577.108 - Choudhury A., Mukherjee S. In silico studies on the comparative characterization of the interactions of SARSCoV- 2 spike glycoprotein with ACE-2 receptor homologs
and human TLRs // J. Med. Virol. 2020. Vol. 92, No. 10. P. 2105–2113. DOI: 10.1002/jmv.25987 - Gadanec L.K., McSweeney K.R., Qaradakhi T. et al. Can SARS-CoV-2 virus use multiple receptors to enter host cells? // Int. J. Mol. Sci. 2021. Vol. 22, No. 3. P. 992.
DOI: 10.3390/ijms22030992 - Patel S. Danger-Associated Molecular Patterns (DAMPs): The derivatives and triggers of inflammation // Curr. Allergy Asthma Rep. 2018. Vol. 18, No. 11. P. 63. DOI: 10.1007/s11882-018-0817-3
- Komai K., Shichita T., Ito M. et al. Role of scavenger receptors as damage-associated molecular pattern receptors in Toll-like receptor activation // Int. Immunol. 2017. Vol. 29,
No. 2. P. 59–70. DOI: 10.1093/intimm/dxx010 - Matzinger P. The danger model: a renewed sense of self // Science. 2002. Vol. 296, No. 5566. P. 301–305. DOI: 10.1126/science.1071059
- Leoratti F.M., Farias L., Alves F.P. et al. Variants in the tolllike receptor signalling pathway and clinical outcomes of malaria // J. Infect. Dis. 2008. Vol. 198, No. 5. P. 772–780.
DOI: 10.1086/590440 - Mailaparambil B., Krueger M., Heinze J. et al. Polymorphisms of toll-like receptors in the genetics of severe RSV associated diseases // Dis. Markers. 2008. Vol. 25, No. 1. P. 59–65. DOI: 10.1155/2008/619595
- Hope A.C.A. A simplified Monte Carlo significance test procedure // Journal of the Royal Statistical Society Series B. 1968. Vol. 30. P. 582–598. DOI: 10.1111/j.2517-6161.1968.tb00759.x
- Benjamini Y., Yekutieli D. The control of the false discovery rate in multiple testing under dependency // Annals of Statistics. 2001. Vol. 29, No. 4. P. 1165–1188. DOI: 10.1214/aos/1013699998
- Clopper C., Pearson E.S. The use of confidence or fiducial limits illustrated in the case of the binomial // Biometrika. 1934. Vol. 26. P. 404–413. DOI: 10.1093/BIOMET/26.4.404
- R Core Team (2020). R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria [Электронный ресурс]. Режим доступа: www.R-project.org/index.htmldex.html. Дата обращения: 29.11.2021.
- Hawn T.R., Misch E.A., Dunstan S.J. et al. A common human TLR1 polymorphism regulates the innate immune responseto lipopeptides // Eur. J. Immunol. 2007. Vol. 37, No. 8. P. 2280–2289. DOI: 10.1002/eji.200737034
- Bramanti B., Stenseth N.C., Walløe L., Lei X. Plague: a disease which changed the path of human civilization // Adv. Exp. Med. Biol. 2016. Vol. 918. P. 1–26. DOI: 10.1007/978-94-024-0890-4_1
- Buntgen U., Ginzler C., Esper J. et al. Digitizing historical plague // Clin. Infect. Dis. 2012. Vol. 55, No. 11. P. 1586–1588. DOI: 10.1093/cid/cis723
- Schmid B.V., Buntgen U., Easterday W.R. et al. Climate-driven introduction of the Black Death and successive plague reintroductions into Europe // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2015. Vol. 112, No. 10. P. 3020–3025. DOI: 10.1073/pnas.1412887112
- Евдокимов А.В. Генетические паттерны кластера TLR10– TLR1–TLR6 популяций Челябинской области (русские, башкиры, нагайбаки) в сопоставлении с некоторыми
евразийскими популяциями: автореф. дис. … канд. биол. наук. Челябинск, 2016.
Выпуск
Другие статьи выпуска
Мигрень — гетерогенное неврологическое заболевание, характеризуется развитием периодических приступов сильной пульсирующей головной боли и связанными с ней нарушениями, которые встречаются у 11–15 % взрослого населения планеты. В статье рассмотрены основные формы мигрени — мигрень с аурой, мигрень без ауры, наследственная гемиплегическая мигрень в контексте их основных клинических симптомов, молекулярных генетических факторов риска, участвующих в сосудистых и неврологических процессах, в том числе активации тригеминоваскулярной системы. Акцент сделан на роли полиморфизмов генов гормонов, нейромедиаторов, их
рецепторов, дисбаланса ионов, ионных каналов, цитокинов и ростовых факторов, молекул адгезии, метаболических ферментов, матриксных металлопротеиназ, ферментов сосудистого тонуса, антиоксидантной защиты, метаболизма липидов, белков с еще не установленной функцией.
Наиболее часто встречаемой высокозлокачественной опухолью головного мозга у взрослого населения является глиобластома. Продолжительность жизни пациентов с данной опухолью не превышает 12–15 мес., при этом в 100 % случаев наблюдаются рецидивы. Одна из главных причин невысокой эффективности терапии глиобластомы — ее множественная лекарственная устойчивость. В развитии последней ключевую роль играют белки-транспортеры ABC-семейства. В данной части акцент сделан на поиске новых молекулярных мишеней среди ростовых факторов, их рецепторов, киназ сигнальной трансдукции, микроРНК, транскрипционных фак- торов, протоонкогенов и генов-супрессоров опухолей, участвующих в регуляции белков и генов ABC-семейства
и связанных с развитием множественной лекарственной устойчивости в клетках глиобластомы. В обзоре также приведены механизмы цитотоксического действия ингибиторов (белки ABC-семейства, тирозинкиназные рецепторы, нерецепторные тирозинкиназы, факторы роста эндотелия сосудов, киназы сигнальных каскадов,
транскрипционные факторы, гистоновые деацетилазы, метилтрансферазы, топоизомеразы, репликация и синтез ДНК, микротрубочек и протеасом), применяемые при терапии глиобластомы или находящиеся на стадии клинических испытаний.
Атеросклероз кровеносных сосудов — одна из основных причин тяжелых хронических сосудистых патологий, нередко протекающих с летальным исходом. Известно, что атеросклероз как воспалительный процесс развивается в несколько этапов и завершается образованием атеросклеротической бляшки, которая при повышенной нестабильности может отрываться и быть причиной тромбоэмболии. Активными участниками процесса атеросклероза являются липопротеины низкой плотности, эндотелий, тромбоциты, нейтрофилы, моноциты/ макрофаги и гладкомышечные клетки стенки сосуда. При этом тромбоциты начинают процесс и завершают его, образуя на поверхности изъязвленной кальцинированной атеросклеротической бляшки тромбоцитарный тромб. Интерес к роли тромбоцитов в воспалительных процессах в настоящее время чрезвычайно вырос, особенно это относится к их способности взаимодействовать с клетками-участниками на разных этапах развития атеросклероза через адгезию, образование агрегаций, обмен экзовезикулами и микрочастицами и посредством взаимно усиливающейся секреции цитокинов, хемокинов, факторов роста и других химических медиаторов. Настоящий
обзор посвящен роли тромбоцитов в формировании в стенке сосуда и регуляции мультиклеточного ансамбля в целом и локальных клеточных модулей, специфичных для каждой стадии развития атеросклероза.
Современные исследования свидетельствуют о возможности использования природных компонентов в качестве источников анаболических соединений. Одними из таковых является новая композиция экстрактов левзеи и шрота клюквы, которая, как было обнаружено ранее, оказывает дозозависимый анаболический эффект.
Цель работы — установить предполагаемый механизм анаболического эффекта у композиции экстрактов левзеи и шрота клюквы.
Материалы и методы. В эксперименте использовали мышей линии CD-1 обоего пола массой 20–25 г. Всем животным измеряли концентрацию тестостерона в крови в динамике: 0 точка (до введения анализируемых композиций), через 30, 60, 120, 180 мин после введения.
Результаты. После однократного введения композиции экстрактов левзеи и шрота клюквы в дозе 70 + 500 мг/кг уровень тестостерона в крови у мышей обоего пола повышался, причем увеличение содержания тестостерона у самок выражено слабее, чем у самцов.
Заключение. Установлен один из предполагаемых механизмов действия анаболического эффекта у композиции, характеризующийся повышением уровня тестостерона крови.
Гетерогенный дисбиоз кишечного микробиома является частым признаком рассеянного склероза. В этом пилотном исследовании мы сравнили уровень некоторых кишечных бактерий у пациентов с рассеянным склерозом, которые получали пероральные препараты, изменяющие течение рассеянного склероза, и у пациентов без терапии.
Материалы и методы. В исследование вошли пациенты с ремиттирующим или вторично прогрессирующим / первично прогрессирующим рассеянным склерозом. Пациенты с рассеянным склерозом получали лечение финголимодом (n = 31), терифлуномидом (n = 21) или не получали лечения (n = 31). Уровни бактерий в образцах стула определяли методом культивирования и полимеразной цепной реакцией в режиме реального времени.
Результаты. Выявлены различия в уровнях симбиотических и условно-патогенных бактерий в образцах фекалий пациентов с рассеянным склерозом, которые получали препараты, изменяющие течение рассеянного склероза, и пациентов без терапии. Кроме того, у этих пациентов существовала разница в спектре расстройств желудочно-кишечного
тракта. У пациентов, получавших финголимод, уровень некоторых видов бактерий был
снижен по сравнению с пациентами без терапии, включая Escherichia coli с нормальной ферментативной активностью, Sutterella wadsworthensis (тип Proteobacteria), бутират-продуцирующие бактерии Roseburia spp., Faecalibacterium prausnitzii и Ruminococcus spp. (тип Firmicutes, класс Clostridia). У пациентов, получавших терифлуномид, наблюда-
лось снижение уровня Lactobacillus spp. и Enterococcus spp. (тип Firmicutes, класс Bacilli) и Ruminococcus spp. Повышенный уровень Bifidobacterium spp. отмечен у пациентов всех групп с более высокими баллами по шкале EDSS.
Выводы. Исследование показало негативное влияние пероральных препаратов, изменяющих течение рассеянного склероза, на состав кишечной микробиоты и расстройства функций желудочно-кишечного тракта. Однако необходимы более масштабные исследования, чтобы подтвердить эти предварительные результаты и разработать способы нормализации дисбиоза кишечника у пациенто
Ранее авторы исследовали реакции сердечно-сосудистой системы здорового человека на сложные динамические постуральные нагрузки с определением индивидуальных предельных режимов постуральных воздействий — знакопеременных периодических изменений угла наклона тела человека, расположенного на ложе поворотного стола, относительно клиностатического положения. Было показано, что использование колебательных пассивных динамических постуральных воздействий позволяет вызывать определенные гемодинамические реакции организма, выраженность которых определяется динамическими характеристиками постуральных воздействий и исходным состоянием испытуемого.
Цель работы — разработка методики комплексного исследования механизмов регуляции кардиоваскулярной, дыхательной, центральной и вегетативной нервной систем и их реакций на физиологические нагрузки с заданными характеристиками (интенсивность, направленность, периодичность и длительность постуральных воздействий).
Материалы и методы. В исследованиях участвовали 30 молодых здоровых испытуемых. Физиологические показатели регистрировали в динамическом режиме синхронно с траекторией перемещения испытуемого, использовали как общепринятые статистические методы, так и оригинальные способы анализа с применением теории динамических систем.
Результаты. Анализ комплекса синхронно регистрируемых физиологических показателей с помощью инструментальных и программных средств, протоколов постуральных воздействий различной интенсивности и направлений движения, в частности, показал, что колебательный пассивный динамический постуральный режим позволяет достигать значимой положительной активации кровообращения и эффективности газообмена, выра-
жающейся в увеличении системного и органного кровотока, без значимого изменения артериального давления, частоты сердечных сокращений и частоты дыхания.
Заключение. Методика непрерывного наблюдения за состоянием испытуемого во время сложных постуральных воздействий позволяет изучать комплекс физиологических реакций с целью разработки научно обоснованных ре
Обоснование. Экзаменационную сессию у студентов можно рассматривать как стрессовый фактор, вследствие которого происходят изменения в основных физиологических параметрах обучающихся, обусловленные выбросом большого количества кортизола.
Цель — оценить показатели красной крови и некоторые показатели агрегатного состояния крови у студентов в различные периоды обучения с учетом половых различий.
Материалы и методы. Дизайн исследования включал 100 обследованных. Из общего числа обследованных относительно здоровых (не предъявляли жалоб, не состояли на диспансерном учете и не имели установленных диагнозов) — 100 человек (50 мужчин и 50 женщин). Отсутствие заболеваний было подтверждено медицинской документацией, так как все лица этой группы проходили ежегодный профилактический осмотр для допуска
к учебе. В исследование были включены добровольцы, возраст которых составлял от 18 до 30 лет, без острых или хронических заболеваний, подписавшие добровольное согласие на участие в исследовании. Средний возраст обследованных составил 23 ± 3 года.
Результаты. На основании представленного исследования установлено, что стрессовая ситуация, вызванная экзаменационной сессией, приводит к выраженным изменениям в системе гемостаза, которые могут быть проявлением дисфункции эндотелия, при этом отмечаются различия между данными изменениями у мужчин и женщин, которые проявляются в показателях красной крови, реологических свойств крови, уровне эндотелина, фактора фон Виллебранда, комплексов tPA–PAI-1, антитромбина III. Помимо этого, при сопоставлении данных уровень фибриногена у женщин был выше, чем у мужчин. Однако, несмотря на выраженные изменения в системе гемостаза, они не носили критического характера и не приводили к развитию патологических состояний, более того, как показали дальнейшие исследования, данные изменения быстро купировались при прекращении воздействия стрессового фактора. После окончания сессии, через 7–8 дней, как у мужчин, так и у женщин все анализируемые показатели возвращались к физиологически нормальным вел
Обоснование. В школе дети постоянно приобретают новые знания, что провоцирует изменения в мозговых структурах, особенно при интенсивном обучении. Нейропластичность позволяет человеку реализовать свой потенциал, проявить одаренность. Однако данные об электроэнцефалографических (ЭЭГ) особенностях во сне
у одаренных школьников недостаточны и противоречивы.
Цель — изучить особенности ЭЭГ-паттернов сна по данным нейрофизиологического исследования у интеллектуально одаренных школьников и их корреляции с вербальными и невербальными умственными способностями.
Материалы и методы. Обследовано 48 лицеистов в возрасте 14–15 лет. Все участники выполняли тест Векслера (детский вариант) для определения уровня интеллекта. Выделено две группы подростков: основная группа (n = 20) — высокий показатель коэффициента интеллекта (IQ) 137,0 ± 12,7 балла, контрольная группа (n = 28) — средний показатель IQ 110,9 ± 10,4 балла. Нейрофизиологическое обследование во время сна проводили с по-
мощью системы для амбулаторной регистрации электроэнцефалограмм и полисомнограмм «Нейрон-Спектр‑СМ» («Нейрософт», Иваново, Россия). Идентификацию и анализ ЭЭГ-паттернов сна — паттернов циклических альтернаций и «сонных веретен» — осуществляли по общепринятой методике. Различия между группами считали
статистически значимыми при р < 0,05.
Результаты. У одаренных детей выявлено значимое увеличение времени и частоты паттернов циклических альтернаций с преобладанием паттерна циклических альтернаций подтипа А1 (р < 0,001) и уменьшение доли подтипов А2 и А3, «сонных веретен» (р = 0,01), значимо коррелирующих с вербальной и невербальной составляющими теста Векслера, такими как индекс гибкости мышления (для частоты паттернов циклических альтернаций
и доли подтипа А1), показатель общего интеллекта и невербальный интеллект, невербальные визуально-пространственные способности, индекс рабочей памяти и индекс вербального восприятия (для доли подтипа А2), а также индекс вербального восприятия, индекс рабочей памяти, индекс скорости обработки информации и п
Издательство
- Издательство
- ЭКО-ВЕКТОР
- Регион
- Россия, Санкт-Петербург
- Почтовый адрес
- 191186, г Санкт-Петербург, Центральный р-н, Аптекарский пер, д 3 литера а, помещ 1Н
- Юр. адрес
- 191186, г Санкт-Петербург, Центральный р-н, Аптекарский пер, д 3 литера а, помещ 1Н
- ФИО
- Щепин Евгений Валентинович (ГЕНЕРАЛЬНЫЙ ДИРЕКТОР)
- E-mail адрес
- e.schepin@eco-vector.com
- Контактный телефон
- +7 (812) 6488366