Статья посвящена проблематике интеграции цифровых технологий в управление образовательной деятельностью высших учебных заведений. В условиях формирования инновационной экономики и развития Индустрии 4.0 происходит цифровая трансформация системы высшего образования и формирование новой модели системы образования «Университет 4.0». В рамках новой модели предполагается активное использование цифровых технологий в процессе обучения и формирование в образовательных организациях современной образовательной среды. Целесообразно формирование в вузах цифровой экосистемы, включающей различные элементы - от цифровой библиотеки до цифрового диплома в системе блокчейн. В статье представлен комплекс ключевых рекомендаций по развитию цифровой трансформации системы высшего образования в условиях инновационной экономики.