В статье осуществлён сравнительный анализ динамики валового регионального продукта Ростовской области, валового внутреннего продукта РФ, установлены основные факторы социо-эколого-экономической дестабилизации водопользования региона (техногенный прессинг отраслей сельского и жилищно-коммунального хозяйства, промышленности на водоёмы, трансграничное загрязнение). Обоснованы организационно-экономические предложения по диверсификации экономики Ростовской области, основывающиеся на реализации имеющихся у региона конкурентных преимуществ. Практическая реализация указанных предложений позволяет снизить зависимость мезоэкономической системы от изменения конъюнктуры мирового аграрного рынка, а также создать предпосылки для сбалансирования территориального социально-экономического развития Ростовской области, усиления конкурентоспособности её экономики на российском и глобальном уровнях. Обоснованные в статье выводы и предложения могут использоваться органами государственной власти Ростовской области, органами местного самоуправления, хозяйствующими субъектами при подготовке документов стратегического планирования, инвестиционных проектов и программ.