Представлены данные о результатах сборки полных геномов двух клинических штаммов Klebsiella pneumoniae сиквенс-типа ST395, выделенных в 2021–2022 гг. в лечебных учреждениях Республики Беларусь.
Проведенное исследование посвящено оценке антимикробной активности пяти комплексных препаратов фитонцидов против планктонных культур и биопленок патогенных микроорганизмов, включая референс-штаммы и клинические изоляты. Антимикробную активность препаратов оценивали методом серийных разведений для определения минимальных бактерицидных концентраций. Была продемонстрирована высокая активность препаратов против грамположительных бактерий Staphylococcus aureus, грамотрицательных бактерий Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii и Pseudomonas aeruginosa, а также против патогенных грибов Candida albicans и Candida auris. Полученные результаты обосновывают целесообразность дальнейших исследований, направленных на детальное изучение механизмов антимикробного действия фитопрепаратов, а также использование данных препаратов в комплексных профилактических мероприятиях.
Инфекции нижних дыхательных путей являются одной из наиболее частых причин смерти в мире. Они могут быть ассоциированы с широким спектром бактериальных, вирусных или грибковых патогенов. Одним из актуальных возбудителей пневмонии является Mycoplasmoides pneumoniae.
Применение наряду с традиционными методами диагностики новых комплексных подходов к анализу клинических образцов, таких как метагеномные исследования, позволяет изучать совокупность патогенов, проводить их генотипирование, устанавливать наличие факторов вирулентности и резистентности.
В данной работе исследованы 464 клинических образца, полученных от пациентов с микоплазменной пневмонией во время вспышки на территории Российской Федерации в период с ноября 2023 г. по февраль 2024 г. Наличие возбудителя M. pneumoniae подтверждено во всех образцах методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Большинство пациентов составляли дети (n = 449), медианный возраст – 12 лет, межквартильный размах – от 10 до 15 лет.
Метагеномный и филогенетический анализы позволили идентифицировать геновариант M. pneumoniae – сиквенстип ST3, относящийся к международному клональному комплексу CC1.
SNP-анализ собранных полных геномов изучаемых образцов M. pneumoniae не выявил мутаций a2063g и/или a2064g в последовательности гена 23S рРНК, наличие которых ассоциировано с устойчивостью патогена к макролидам. Таким образом, можно предположить, что микоплазмы, содержащиеся в образцах, чувствительны к макролидам.