ПОПУЛЯЦИОННО-ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ КИЖУЧА (ONCORHYNCHUS KISUTCH WALBAUM) НА АЗИАТСКОЙ ЧАСТИ АРЕАЛА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ АНАЛИЗА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ ЛОКУСОВ (2023)
Впервые исследован полиморфизм 10 ядерных микросателлитных локусов в популяциях кижуча на азиатской части ареала.
Выявлены три генетически обособленных региональных комплекса стад: камчатский, североохотоморский и сахалинский.
Показано, что для всех популяций вне зависимости от их географического положения характерен высокий уровень генетического полиморфизма.
Идентификаторы и классификаторы
Кижуч (Oncorhynchus kisutch Walbaum, 1792) является представителем тихоокеанских лососей рода Oncorhynchus — группы ценных промысловых видов, обитающих как на Дальнем Востоке, так и в странах Северной Америки.
Этот вид распространен в Северной Пацифике: нерестится он на азиатском побережье — от Чукотки до северной части Хабаровского края, включая о. Сахалин и северные острова Курильской гряды, на американском — от Аляски до Калифорнии (Зорбиди, 2010).
В пределах азиатской части ареала кижуч является третьим-четвертым по численности видом рода Oncorhynchus, только лишь на Северных Курилах он занимает второе место, уступая наиболее массовому виду этого рода — горбуше.
Список литературы
Зеленина Д.А., Сошнина В.А., Сергеев А.А. 2020. Филогеография и митохондриальный . полиморфизм кижуча азиатских стад // Молекулярная биология. Т. 54. С. 997–1005.
2. Зорбиди Ж.Х. 2010. Кижуч азиатских стад. Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО. 206 с. Пустовойт С.П. 1995. Особенности генетической структуры кижуча Oncorhynchus kisutch (Walbaum) // Генетика. Т. 31. С. 709–714.
3. Beacham T.D., Miller K.M., Withler R.E. 1996. Minisatellite DNA variation and stock identification of coho salmon // J. Fish Biol. Vol. 49. P. 411–429.
4. Evanno G., Regnaut S., Goudet J. 2005. Detecting the number of clusters of individuals using the software structure: a simulation study // Mol. Ecol. Vol. 14. P. 2611–2620.
5. Ivanova N.V., deWaard J., Hebert P.D.N. 2006. An inexpensive, automation-friendly protocol for recovering high-quality DNA // Mol. Ecol. Notes. Vol. 6. P. 998–1002.
6. Kalinowski S.T., Taper M.L., Marshall T.C. 2007. Revising how the computer program CERVUS accommodates genotyping error increases success in paternity assignment // Mol. Ecol. Vol. 16. P. 1099–1106.
7. Li Y.L., Liu J.X. 2018. StructureSelector: a web based software to select and visualize the optimal number of clusters using multiple methods // Mol. Ecol. Res. Vol. 18. P. 176–177.
8. Nakamura Y., Shigenobu Y., Sugaya T., Kurokawa T., Saitoh K. 2013. Automated screening and
primer design of fi sh microsatellite DNA loci on pyrosequencing data // Ichthyological research.
Vol. 60. P. 184–187.
9. Nei M. 1987. Molecular evolutionary genetics. N.Y.: Columbia Univ. press. 512 p.
Olsen J.B., Wilson S.L., Kretschmer E.J., Jones K.C., Seeb J.E. 2000. Characterization of 14 tetranucleotide microsatellite loci derived from sockeye salmon // Mol. Ecol. Vol. 9 (12). P. 2185–2187.
10. Peakall R., Smouse P.E. 2006. GenAlEx 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Notes. Vol. 6. P. 299–295.
11. Pritchard J., Stephens K., Donnely P. 2000. Inference of population structure from multilocus genotype data // Genetics. Vol. 155. P. 945–959.
12. Puechmaille S.J. 2016. The program structure does not reliably recover the correct population structure when sampling is uneven: subsampling and new estimators alleviate the problem // Mol. Ecol. Res. Vol. 16. P. 608–627.
13. Rougemont Q., Moore J.S., Leroy T., Normandeau E., Rondeau E.B., Withler R.E., Withler R.E.,
Van Doornik D.M., Crane P., Naish K.A., Garza J.C., Beacham T.D., Koop B.F., Bernatchez L. 2020. Demographic history shaped geographical patterns of deleterious mutation load in a broadly distributed Pacifi c Salmon // PLoS genetics. Vol. 16 (8). https:// journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/ journal.pgen.1008348
14. Smith C.T., Koop B.F., Nelson R.J. 1998. Isolation and characterization of coho salmon (Oncorhynchus kisutch) microsatellites and their use in other salmonids // Mol. Ecol. Vol. 7. P. 1614–1616.
15. Smith C.T., Nelson R.J., Wood C.C., Koop B.F. 2001. Glacial biogeography of North American coho salmon (Oncorhynchus kisutch) // Mol. Ecol. Vol. 10. P. 2775–2785.
16. Williamson K.S., Cordes J.F., May B. 2002. Characterization of microsatellite loci in Chinook salmon (Oncorhynchus tschawytscha) and cross-species amplifi cation in other salmonids // Mol. Ecol. Notes. Vol. 2 (1). P. 17–19.
Выпуск
Объектами исследований являются морские анадромные и пресноводные рыбы, промысловые беспозвоночные, морские млекопитающие, а также условия обитания видов. Рассматриваются проблемы структуры сообществ, дифференциации популяций, ихтиологии, экологии, трофологии, физиологии, гидробиологии, паразитологии, гидрологии и гидрохимии, рыбного хозяйства и экономики.
Включенные в журнал работы будут интересны ихтиологам, гидробиологам, экологам, паразитологам, студентам биологических факультетов вузов, работникам рыбохозяйственных организаций, а также всем, кто связан с освоением, охраной и воспроизводством биологических ресурсов северо-западной части Тихого океана.
Другие статьи выпуска
Проведен анализ встречаемости морских млекопитающих на разных видах промысла
водных биоресурсов, а также взаимодействия между морскими млекопитающими и морским рыболовством в Охотском и Беринговом морях и тихоокеанских водах, примыкающих к восточному побережью Камчатки и Курильских островов.
Выполнена классификация видов морских млекопитающих по степени их зависимости от рыболовства.
Рассмотрены промысел и некоторые стороны биологии тихоокеанского морского окуня
Sebastes alutus у Командорских островов.
Установлено, что добыча этого вида имеет эпизодический характер, не подвержена сезонной динамике и осуществляется на локальном участке, расположенном западнее о. Беринга.
Вклад данной акватории в общий вылов морских окуней в Петропавловско-Командорской подзоне в 2001–2022 гг. не превышал 26,5%. У Командорских островов S. alutus отмечался на глубинах 138–370 м при температуре воды у дна 3,1–3,9 °С, а в уловах представлен особями длиной 17–45 см.
Предполагается, что образование скоплений в верхней части материкового склона
западнее о. Беринга обусловлено наличием антициклонического круговорота, который способствует формированию высоких концентраций зоопланктона, как основного объекта питания, и благоприятных условий для развития выметанных личинок.
Представлены результаты исследований возрастной структуры, размерно-массового состава производителей и абсолютной плодовитости самок нерки стада р. Озерной.
Вся нерка р. Озерной по мере созревания возвращается на нерест в возрасте 3+, 4+, 5+, 6+ и 7+ лет.
Для относительной численности нерки возраста 5+, 6+ и численности поколений прослежен положительный, а для нерки возраста 4+ — отрицательный тренд.
Для средних размерно-массовых показателей и средней абсолютной плодовитости нерки р. Озерной в исследованные годы отмечали отрицательную динамику.
Выявлены закономерности изменения биологических показателей рыб в зависимости от плотностных факторов в 1971–2020 гг.
На основании полиморфизма микросателлитных локусов исследована выборка кеты из
уловов осенних траловых учетных съемок в Охотском море (2016–2021 гг.), в состав которой включены особи, имеющие отолитные метки японских лососевых рыбоводных заводов (ЛРЗ).
Ранее созданная референтная база данных частот восьми микросателлитных локусов, включающая 26 выборок кеты из основных регионов воспроизводства Охотоморского бассейна, пополнена информацией по аллельной изменчивости микросателлитов кеты
о-вов Хоккайдо и Хонсю.
Результаты исследования свидетельствуют о выраженном сходстве кеты Курильских островов и особей, выпущенных с ЛРЗ Японии.
Исследовано генетическое разнообразие нерки Курильских (о-ва Итуруп, Уруп, Пара- мушир, Шумшу) и Командорских островов (о. Беринга) по семи микросателлитным локусам.
Средние оценки наблюдаемой гетерозиготности по разным локусам варьировали от 0,300 до 0,858.
Общая оценка генетической дифференциации θst составила 15%, с 95%-м доверительным бутстреп-интервалом (10,40–21,18%).
Результаты, полученные в программе BOTTLENECK 1.2.02, позволили выявить прохождение всеми островными популяциями «бутылочного горлышка».
Показано, что все пять исследованных популяций значительно различаются друг от друга, и каждой из них присущи свои уникальные свойства.
Уровень внутрипопуляционного разнообразия, выявленный у нерки Курил и Командор, является существенно ниже такового в материковых водоемах, что в целом характерно
для популяций, обитающих на окраинах ареала.
Представлены данные о региональном составе морских смешанных скоплений молоди
горбуши Охотоморского бассейна в период посткатадромных миграций 2022 г.
Выявлена высокая вероятность значительного преобладания нерестовых возвратов горбуши северного комплекса стад в 2023 г. относительно величины ее подходов в южные регионы.
Идентификационные оценки молоди, полученные по результатам RFLP-анализа мтДНК и анализа аллельной изменчивости SNP-локусов, соотнесены с величинами фактических региональных уловов и нерестовых подходов.
Отмечено близкое соответствие расчетных оценок и фактических данных по итогам путины 2023 г. Полностью подтвердился прогноз о преобладании горбуши северного комплекса стад, а также о нетипично малой доле рыб из водных объектов о. Итуруп. Близки к фактическому вылову и оценки по о. Сахалин южной части материкового побережья Охотского моря.
Издательство
- Издательство
- ВНИРО
- Регион
- Россия, Москва
- Почтовый адрес
- г. Москва, Окружной проезд, 19.
- Юр. адрес
- г. Москва, Окружной проезд, 19.
- ФИО
- Колончин Кирилл Викторович (ДИРЕКТОР )
- E-mail адрес
- vniro@vniro.ru
- Контактный телефон
- +7 (499) 2649387
- Сайт
- http://vniro.ru/