ГЕНЕТИЧЕСКАЯ И ДЕНТИФИКАЦИЯ МОЛОДИ ГОРБУШИ ONCORHYNCHUS GORBUSCHA (WALBAUM) НЕЧЕТНОЙ ЛИНИИ ВОСПРОИЗВОДСТВА ПО РЕЗУЛЬТАТАМ РЕСТРИКЦИОННОГО АНАЛИЗА МИТОХОНДРИАЛЬНОЙ ДНК И АНАЛИЗА ОДНОНУКЛЕОТИДНЫХ ПОЛИМОРФИЗМОВ (2023)
Представлены данные о региональном составе морских смешанных скоплений молоди
горбуши Охотоморского бассейна в период посткатадромных миграций 2022 г.
Выявлена высокая вероятность значительного преобладания нерестовых возвратов горбуши северного комплекса стад в 2023 г. относительно величины ее подходов в южные регионы.
Идентификационные оценки молоди, полученные по результатам RFLP-анализа мтДНК и анализа аллельной изменчивости SNP-локусов, соотнесены с величинами фактических региональных уловов и нерестовых подходов.
Отмечено близкое соответствие расчетных оценок и фактических данных по итогам путины 2023 г. Полностью подтвердился прогноз о преобладании горбуши северного комплекса стад, а также о нетипично малой доле рыб из водных объектов о. Итуруп. Близки к фактическому вылову и оценки по о. Сахалин южной части материкового побережья Охотского моря.
Идентификаторы и классификаторы
Горбуша общепризнанно является наиболее сложным объектом для прогнозирования численности нерестовых подходов в регионы воспроизводства. Среди видов тихоокеанских лососей для нее характерны самая высокая численность и широкий диапазон ее флуктуации,
самый короткий — двухлетний — жизненный цикл.
Список литературы
- Бугаев А.В., Герлиц А.И. 2023. Характеристика нагульных миграций заводской молоди тихоокеанских лососей в бассейне Охотского моря и прилегающих водах Тихого океана в осенне-зимний период (региональная идентификация, численность и распределение уловов, биологические показатели, оценки смертности) // Изв. ТИНРО. Т. 203, № 1. С. 16–45.
- Бугаев А.В., Зикунова О.В., Шпигальская Н.Ю., Артюхина Н.Б., Шубкин С.В., Коваленко М.Н., Лозовой А.П. 2023. Аналитический обзор итогов лососевых путин в Камчатском крае в 2018–2022 гг. (прогнозы, промысел, запасы). Сообщение 1 (горбуша, кета) // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Вып. 68. С. 5–41.
- Бугаев А.В., Шпигальская Н.Ю., Зикунова О.В., Фельдман М.Г., Заварина Л.О., Дубынин В.А., Артюхина Н.Б., Шубкин С.В., Ерохин В.Г., Коваль М.В., Коваленко М.Н., Бирюков А.М., Фадеев Е.С., Нагорнов А.А. 2018. Аналитический обзор итогов лососевой путины–2018 (Камчатский край) // Бюллетень изучения тихоокеанских лососей на Дальнем Востоке. № 13. Владивосток: ТИНРО-Центр. С. 14–40.
- Варнавская Н.В. 2006. Генетическая дифференциация популяций тихоокеанских лососей. Петропавловск-Камчатский: КамчатНИРО. 488 с.
- Гордеева Н.В. 2012. Высокие оценки дифференциации популяций горбуши Oncorynchus
gorbuscha по локусу главного комплекса гистосовместимости MHC-I A1 поддерживают гипотезу «локальных стад» // Вопр. ихтиологии. Т. 52, № 1. С. 72–81. - Зеленина Д.А., Животовский Л.А., Сошнина В.А., Вилкова О.Ю., Глубоковский М.К. 2022. Внутривидовая дифференциация азиатской горбуши по данным последовательности митохондриального гена cytb // Генетика. Т. 58, № 11. С. 1280–1291. Косицына А.И., Шпигальская Н.Ю., Сергеев А.А., Сошнина В.А., Савенков В.В., Денисенко А.Д., Муравская У.О., Зеленина Д.А. 2022. Генетическая идентификация молоди горбуши Oncorhynchus
gorbuscha (Walbaum) Охотоморского бассейна по результатам рестрикционного анализа митохондриальной ДНК и анализа однонуклеотидных полиморфизмов // Исслед. водн. биол. ресурсов Камчатки и сев.-зап. части Тихого океана. Вып. 66. С. 52–67. - Чуриков Д.Ю. 2001. Генеалогия гаплотипов митохондриальной ДНК у нескольких видов тихоокеанских лососей : Автореф. дис. … канд. биол. наук. СПбГУ. 17 с. Шевляков Е.А., Сомов А.А., Шевляков В.А., Канзепарова А.Н., Дедерер Н.А., Мельников И.В. 2023.
- Промысел горбуши в Дальневосточном рыбопромысловом бассейне в 2022 г.: предварительные исследования, прогноз, интерпретация итогов путины // Бюллетень изучения тихоокеанских лососей на Дальнем Востоке. № 17. Владивосток:
ТИНРО-Центр. С. 101–109. Шпигальская Н.Ю., Брыков Вл.А., Кухлевский А.Д., Сараванский О.Н., Климов А.В., Четвертак А.А., Шевляков Е.А. 2011. Региональная идентификация
смешанных морских скоплений молоди горбуши (Oncorhynchus gorbuscha Walbaum) на основе изменчивости фрагмента Cytb/D-loop митохондриальной ДНК // Изв. ТИНРО. Т. 165. С. 89–103. - Churikov D., Gharrett A.J. 2002. Comparative phylogeograph of the two pink salmon broodlines: an analysis based on a mitochondrial DNA genealogy // Mol. Ecol. № 11. P. 1077–1101. doi: 10.1046/j.1365-294x.2002.01506.x He C., Holme J., Anthony J. 2014. SNP genotyping: the KASP assay // Methods Mol. Biol. Vol. 1145. P. 75–86.
- Ivanova N.V., deWaard J., Hebert P.D.N. 2006. An inexpensive, automation-friendly protocol for recovering high-quality DNA // Mol. Ecol. Notes. Vol. 6. P. 998–1002.
- Masuda M., Nelson S., Pella J. 1991. The computer programs for computing conditional maximum likely estimates of stock composition from discrete characters // NOAA Tech. Rep. NMFS № 244. Auke Bay Laboratory, Juneau, AK. 11 p.
- Peakall R., Smouse P.E. 2006. GenAlEx 6: genetic analysi in Excel. Population genetic software for teaching and research // Mol. Ecol. Notes. Vol. 6. P. 299–295.
- Pella J., Masuda M., Nelson S. 1996. Search algorithms for computing stock composition of mixture from traits of individuals by maximum likelihood // NOAA Tech. Memo. NMFS-AFSC. № 61. 68 p.
- Schneider S., Roessli D., Excoffi er L. 2000. Arlequin ver. 2.000: A software for population genetics data analysis. Genetics and Biometry Laboratory, Univ. Geneva, Switzerland.
Shpigalskaya N.Yu., Brykov Vl.А., Kukhlevsky А.D., Chetvertak А.А. 2012. Polymorphism of mitochondrial DNA (mtDNA) of the Cytb/D-loop region in pink salmon populations // NPAFC Tech. Rep. № 8. P. 62–63. - Shpigalskaya N.Yu., Kositsina A.I., Muravskaya U.O., Saravansky O.N. 2016. Genetic identifi cation of juvenile pink salmon improves accuracy of forecasts of spawning runs in the Okhotsk Sea basin // NPAFC Bull. № 6. P. 415–420.
- Shpigalskaya N.Yu., Muravskaya U.O., Kositsina A.I.,иKlimov A.V. 2013. Genetic identifi cation of Okhotsk Sea juvenile pink salmon mixed-stock aggregations during the early marine period of life // NPAFC Tech. Rep. № 9. P. 45–48.
- Zelenina D.A., Sergeev A.A., Kositsina A.I., Soshnina V.A., Shpigalskaya N.Y. 2023. SNP-based discrimination of pink salmon stocks of the Sea of Okhotsk basin: resolution of the approach and possible ways to increase it // Front. Mar. Sci. 10:1140538. doi: 10.3389/fmars.2023.1140538.
Выпуск
Объектами исследований являются морские анадромные и пресноводные рыбы, промысловые беспозвоночные, морские млекопитающие, а также условия обитания видов. Рассматриваются проблемы структуры сообществ, дифференциации популяций, ихтиологии, экологии, трофологии, физиологии, гидробиологии, паразитологии, гидрологии и гидрохимии, рыбного хозяйства и экономики.
Включенные в журнал работы будут интересны ихтиологам, гидробиологам, экологам, паразитологам, студентам биологических факультетов вузов, работникам рыбохозяйственных организаций, а также всем, кто связан с освоением, охраной и воспроизводством биологических ресурсов северо-западной части Тихого океана.
Другие статьи выпуска
Проведен анализ встречаемости морских млекопитающих на разных видах промысла
водных биоресурсов, а также взаимодействия между морскими млекопитающими и морским рыболовством в Охотском и Беринговом морях и тихоокеанских водах, примыкающих к восточному побережью Камчатки и Курильских островов.
Выполнена классификация видов морских млекопитающих по степени их зависимости от рыболовства.
Рассмотрены промысел и некоторые стороны биологии тихоокеанского морского окуня
Sebastes alutus у Командорских островов.
Установлено, что добыча этого вида имеет эпизодический характер, не подвержена сезонной динамике и осуществляется на локальном участке, расположенном западнее о. Беринга.
Вклад данной акватории в общий вылов морских окуней в Петропавловско-Командорской подзоне в 2001–2022 гг. не превышал 26,5%. У Командорских островов S. alutus отмечался на глубинах 138–370 м при температуре воды у дна 3,1–3,9 °С, а в уловах представлен особями длиной 17–45 см.
Предполагается, что образование скоплений в верхней части материкового склона
западнее о. Беринга обусловлено наличием антициклонического круговорота, который способствует формированию высоких концентраций зоопланктона, как основного объекта питания, и благоприятных условий для развития выметанных личинок.
Представлены результаты исследований возрастной структуры, размерно-массового состава производителей и абсолютной плодовитости самок нерки стада р. Озерной.
Вся нерка р. Озерной по мере созревания возвращается на нерест в возрасте 3+, 4+, 5+, 6+ и 7+ лет.
Для относительной численности нерки возраста 5+, 6+ и численности поколений прослежен положительный, а для нерки возраста 4+ — отрицательный тренд.
Для средних размерно-массовых показателей и средней абсолютной плодовитости нерки р. Озерной в исследованные годы отмечали отрицательную динамику.
Выявлены закономерности изменения биологических показателей рыб в зависимости от плотностных факторов в 1971–2020 гг.
На основании полиморфизма микросателлитных локусов исследована выборка кеты из
уловов осенних траловых учетных съемок в Охотском море (2016–2021 гг.), в состав которой включены особи, имеющие отолитные метки японских лососевых рыбоводных заводов (ЛРЗ).
Ранее созданная референтная база данных частот восьми микросателлитных локусов, включающая 26 выборок кеты из основных регионов воспроизводства Охотоморского бассейна, пополнена информацией по аллельной изменчивости микросателлитов кеты
о-вов Хоккайдо и Хонсю.
Результаты исследования свидетельствуют о выраженном сходстве кеты Курильских островов и особей, выпущенных с ЛРЗ Японии.
Исследовано генетическое разнообразие нерки Курильских (о-ва Итуруп, Уруп, Пара- мушир, Шумшу) и Командорских островов (о. Беринга) по семи микросателлитным локусам.
Средние оценки наблюдаемой гетерозиготности по разным локусам варьировали от 0,300 до 0,858.
Общая оценка генетической дифференциации θst составила 15%, с 95%-м доверительным бутстреп-интервалом (10,40–21,18%).
Результаты, полученные в программе BOTTLENECK 1.2.02, позволили выявить прохождение всеми островными популяциями «бутылочного горлышка».
Показано, что все пять исследованных популяций значительно различаются друг от друга, и каждой из них присущи свои уникальные свойства.
Уровень внутрипопуляционного разнообразия, выявленный у нерки Курил и Командор, является существенно ниже такового в материковых водоемах, что в целом характерно
для популяций, обитающих на окраинах ареала.
Впервые исследован полиморфизм 10 ядерных микросателлитных локусов в популяциях кижуча на азиатской части ареала.
Выявлены три генетически обособленных региональных комплекса стад: камчатский, североохотоморский и сахалинский.
Показано, что для всех популяций вне зависимости от их географического положения характерен высокий уровень генетического полиморфизма.
Издательство
- Издательство
- ВНИРО
- Регион
- Россия, Москва
- Почтовый адрес
- г. Москва, Окружной проезд, 19.
- Юр. адрес
- г. Москва, Окружной проезд, 19.
- ФИО
- Колончин Кирилл Викторович (ДИРЕКТОР )
- E-mail адрес
- vniro@vniro.ru
- Контактный телефон
- +7 (499) 2649387
- Сайт
- http://vniro.ru/