Текущий спецвыпуск журнала посвящен памяти Сергея Ивановича Бажана (1949–2022). С. И. Бажан родился в 1949 г. в станице Владимировская Зверевского района Ростовской области. Его отец, Иван Никонович, был украинцем, после войны окончил Черниговский политехнический институт и получил распределение на работу в Кузнецкий угольный бассейн. Так семья Бажанов оказалась в Сибири. Его мама, Тамара Ивановна, была донской казачкой, всю жизнь проработала учителем математики в средней школе. У Сергея есть два младших брата – Анатолий и Александр. Любовь и уважение царили в этой семье. Сергей имел математический склад ума и побеждал на всех школьных олимпиадах по математике. Когда ему исполнилось 14 лет, он был приглашен в Физико-математическую школу в Академгородок. После окончания школы в 1966 г. он поступил на биологическое отделение факультета естественных наук Новосибирского государственного университета (НГУ). После третьего курса в 1969 г. Сергей поступил на кафедру физиологии в лабораторию эндокринологии, которой руководил доктор медицинских наук, профессор Михаил Григорьевич Колпаков (https://museum. icgbio. ru/lichnosti/pervie).
Идентификаторы и классификаторы
Работоспособность Сергея была феноменальной. Он мог работать круглосуточно: сесть за компьютер уже после 21:00 и работать сколь угодно долго. Когда мы жили в Израиле, где ему делали пересадку костного мозга, он тоже работал. Каждый день он общался по телефону с Л. И. Карпенко, и в итоге за годы болезни (2019–2022 гг.) с его участием было опубликовано несколько статей в англоязычных журналах с высоким импакт-фактором (Bazhan et al., 2019, 2022; Karpenko et al., 2020; Borgoyakova et al., 2022). Формально Сергей Иванович работал в ИЦиГ только в годы своей учебы в аспирантуре в 1972–1975 гг., однако фактически его связи с ИЦиГ не прерывались до конца жизни, поскольку он дружил и сотрудничал с Виталием Александровичем Лихошваем (Бажан, 2020). Их дружба началась со времени совместной работы в Центре вирусологии «Вектор». Еще в конце 1970-х гг. они вместе заложили вычислительную основу, а затем с коллегами развили блочно-модульную методологию автоматизации задач реконструкции и анализа математических моделей молекулярно-генетических систем. О вкладе Сергея в развитие системной биологии и о совместных с ним исследованиях написано в статье Н. А. Колчанова, С. А. Лашина, Ф. В. Казанцева и Ю. Г. Матушкина «Развитие сибирской школы математической (системной) биологии» (2023).
Список литературы
1. Бажан С.И. Ренин-ангиотензинная регуляция секреции и метаболизма альдостерона. Автореф. дис.... канд. биол. наук. М., 1977.
Bazhan S.I. Renin-angiotensin regulation of aldosterone secretion and metabolism. Cand. Sci. (Biol.) Dissertation. Moscow, 1977 (in Russian).
2. Бажан С.И. Теоретическое исследование механизмов противовирусного иммунитета. Автореф. дис.... д-ра биол. наук. Кольцово, 2008. EDN: QEHSEF
Bazhan S.I. Theoretical study of the mechanisms of antiviral immunity. Doctor Sci. (Biol.) Dissertation. Koltsovo, 2008 (in Russian). EDN: QEHSEF
3. Бажан С.И. Виталий Александрович Лихошвай: первые шаги в науке. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции. 2020;6(4):164-167. DOI: 10.18699/Letters2020-6-20 EDN: KEHDYY
Bazhan S.I. Vitaly Likhoshvai: the first steps in science. Pisma v Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Letters to Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2020;6(4):164-167. 10.18699/Letters2020-6-20 (in Russian). DOI: 10.18699/Letters2020-6-20(inRussian) EDN: KEHDYY
4. Карпенко Л.И., Ильичев А.А. Дизайн искусственных полиэпитопных Т-клеточных иммуногенов для создания профилактических и терапевтических вакцин. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023;9(4):192-200. DOI: 10.18699/LettersVJ-2023-9-22 EDN: UAKKBC
Karpenko L.I., Ilyichev A.A. Design of artificial polyepitope T-cell immunogens for the creation of prophylactic and therapeutic vaccines. Pisma v Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Letters to Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2023;9(4):192-200. 10.18699/LettersVJ-2023-9-22 (in Russian). DOI: 10.18699/LettersVJ-2023-9-22(inRussian) EDN: UAKKBC
5. Колчанов Н.А., Лашин С.А., Казанцев Ф.В., Матушкин Ю.Г. Развитие сибирской школы математической (системной) биологии. Письма в Вавиловский журнал генетики и селекции. 2023;9(4):185-191. DOI: 10.18699/LettersVJ-2023-9-21 EDN: BBTMBL
Kolchanov N.A., Lashin S.A., Kazantsev F.V., Matushkin Yu.G. Development of the Siberian school of mathematical (systems) biology. Pisma v Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Letters to Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2023;9(4):185-191. 10.18699/LettersVJ-2023-9-21 (in Russian). DOI: 10.18699/LettersVJ-2023-9-21(inRussian) EDN: BBTMBL
6. Bazhan S.I., Antonets D.V., Karpenko L.I., Oreshkova S.F., Kaplina O.N., Starostina E.V., Dudko S.G., Fedotova S.A., Ilyichev A.A. In silico designed Ebola virus T-cell multi-epitope DNA vaccine constructions are immunogenic in mice. Vaccines ( Basel). 2019;7(2):34. DOI: 10.3390/vaccines7020034 EDN: ASRAUM
7. Bazhan S.I., Antonets D.V., Starostina E.V., Ilyicheva T.N., Kaplina O.N., Marchenko V.Y., Volkova O.Y., Bakulina A.Y., Karpenko L.I. In silico design of influenza a virus artificial epitope-based T-cell antigens and the evaluation of their immunogenicity in mice. J. Biomol. Struct. Dyn. 2022;40(7):3196-3212. DOI: 10.1080/07391102.2020.1845978 EDN: HATSDT
8. Borgoyakova M.B., Karpenko L.I., Rudometov A.P., Volosnikova E.A., Merkuleva I.A., Starostina E.V., Zadorozhny A.M., Isaeva A.A., Nesmeyanova V.S., Shanshin D.V., Baranov K.O., Volkova N.V., Zaitsev B.N., Orlova L.A., Zaykovskaya A.V., Pyankov O.V., Danilenko E.D., Bazhan S.I., Shcherbakov D.N., Taranin A.V., Ilyichev A.A. Self-assembled particles combining SARS-CoV-2 RBD protein and RBD DNA vaccine induce synergistic enhancement of the humoral response in mice. Int. J. Mol. Sci. 2022;23(4):2188. DOI: 10.3390/ijms23042188 EDN: WZTDCG
9. Karpenko L.I., Apartsin E.K., Dudko S.G., Starostina E.V., Kaplina O.N., Antonets D.V., Volosnikova E.A., Zaitsev B.N., Bakulina A.Y., Venyaminova A.G., Ilyichev A.A., Bazhan S.I. Cationic polymers for the delivery of the Ebola DNA vaccine encoding artificial T-cell immunogen. Vaccines (Basel). 2020;8(4):718. DOI: 10.3390/vaccines8040718 EDN: OMASOG
Выпуск
Другие статьи выпуска
В настоящее время в селекционном процессе, связанном с получением отдаленных гибридов, широко применяют биотехнологические подходы. Проблему неразвития эндосперма и гибели зародыша на ранних стадиях эмбриогенеза у гибридных зерновок можно решить с помощью метода культуры ткани. В данной работе представлены результаты получения гибридов в прямых и обратных скрещиваниях гексаплоидной тритикале (сортов Орден, Садко, линии ДТ-43 и селекционной линии Сиарс), мягкой пшеницы-донора фиолетовой окраски зерна (линия i: S29PF ) и фиолетовозерной полбы (линии 27-3/17 и31/16) с использованием метода эмбриокультуры in vitro. Этот способ позволил получить в общей сложности 41 растение F1 из 114 выделенных эксплантов. Получены фертильные растения F2 из комбинаций с донорами фиолетовой окраски зерна Орден × i: S29PF, i: S29PF × Орден и Садко × 27-3/17, которые в дальнейшем будут включены в селекционный процесс. Таким образом, биотехнологические подходы играют важную роль в создании исходного селекционного материала и преодолении несовместимости родительских форм в отдаленных скрещиваниях пшеницы с тритикале.
Необходимость уборки урожая до наступления неблагоприятных погодных условий определяет оптимальные сроки цветения и созревания культурных растений для каждой географической зоны. Продолжительность вегетационного периода у подсолнечника Helianthus annuus L. зависит от генотипа сорта, природно-климатических условий выращивания и контролируется сложной регуляторной системой, включающей множество генов. Важную роль в этой системе играют гены-интеграторы, которые объединяют различные сигналы и в зависимости от уровня своей экспрессии влияют на активность генов-мишеней, детерминирующих процессы дифференцировки тех или иных органов и тканей. Один из таких генов-интеграторов - флориген FT, или активатор цветения. Ортологи гена FT обнаружены у многих культурных растений, в том числе у подсолнечника. Кроме этого гена в геноме подсолнечника идентифицирован ряд генов фотопериодической регуляции, включая CONSTANS, а также другие гены и QTL, влияющие на время цветения. Данный обзор посвящен обсуждению роли различных генетических локусов в детерминации указанного признака у подсолнечника, а также поиску генов-мишеней для маркер-ориентированной селекции сортов этой культуры, приспособленных к различным климатическим условиям.
Для эффективной селекции пшеницы на устойчивость к стеблевой ржавчине необходимо исследование популяций гриба, циркулирующих на посевах в конкретном регионе. Выявление вероятных источников инфекции возможно в результате отслеживания основных путей миграции спор патогена по всей территории возделывания пшеницы в пределах одной климатической зоны. Для ускоренного анализа и охвата большей выборки образцов предложено использовать микросателлитные маркеры, представляющие альтернативу традиционному фитопатологическому анализу состава генов вирулентности популяции. С их помощью проведено генотипирование монопустульных изолятов Puccinia graminis f. sp. tritici, собранных в Центральном регионе России и Поволжье на мягкой яровой пшенице, установлена высокая степень дифференциации между популяциями патогена. Предложена схема диагностики происхождения инфекции с помощью шкалы размеров аллелей микросателлитных маркеров.
Сергей Иванович Бажан начал работать в «Векторе» в 1975 г. по личному приглашению академика Л. С. Сандахчиева и стал одним из основоположников новых научных направлений организации. Все без исключения, кому посчастливилось учиться у него, работать с ним и даже просто встречаться на научных форумах, признавали, каким неординарным и разносторонним человеком был Сергей Иванович. Талантливый ученый, автор более 300 статей, 20 патентов и ряда научных монографий, изданных в России и за рубежом. Его научные интересы простирались от разработки математических моделей для систем «вирус - хозяин» до исследования механизмов действия интерферона и противовирусного иммунитета. С. И. Бажан был одним из первых ученых в мире, начавшим работы по дизайну искусственных поли-CTL-эпитопных Т-клеточных иммуногенов для создания профилактических вакцин против вирусных инфекций и терапевтических - против онкологических заболеваний. В данной статье мы хотим рассказать об этих исследованиях Сергея Ивановича, над которыми нам посчастливилось трудиться вместе с ним.
В статье описан вклад Сергея Ивановича Бажана в развитие методов компьютерного моделирования сложных биологических систем. Химико-кинетический метод моделирования, предложенный С. И. Бажаном и его коллегой В. А. Лихошваем во время работы в ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» в 1970-х гг., оказался исключительно удачным и эффективным инструментом исследования динамики сложных, иерархически организованных биологических систем. Данный способ представляет собой одно из важнейших достижений сибирской школы математической/системной биологии и биоинформатики. Концепции, почти полвека назад ставшие основой этого подхода, до сих пор соответствуют тенденциям современной системной биологии.
В статье описан вклад Сергея Ивановича Бажана в развитие методов компьютерного моделирования сложных биологических систем. Химико-кинетический метод моделирования, предложенный С. И. Бажаном и его коллегой В. А. Лихошваем во время работы в ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» в 1970-х гг., оказался исключительно удачным и эффективным инструментом исследования динамики сложных, иерархически организованных биологических систем. Данный способ представляет собой одно из важнейших достижений сибирской школы математической/системной биологии и биоинформатики. Концепции, почти полвека назад ставшие основой этого подхода, до сих пор соответствуют тенденциям современной системной биологии.
Издательство
- Издательство
- НИИТПМ
- Регион
- Россия, Новосибирск
- Почтовый адрес
- 630089, г. Новосибирск, ул. Б. Богаткова, 175/1, Метро "Золотая нива", Автобус "Молодежная, Кошурникова"
- Юр. адрес
- 630090, г. Новосибирск, пр-т Академика Лаврентьева, 10
- ФИО
- Рагино Юлия Игоревна (Руководитель)
- Контактный телефон
- +7 (383) 3730981
- Сайт
- https://iimed.ru/