В статье рассмотрены процессы формирования предпринимательского университета (в русскоязычной среде известного больше как концепция «Университет 3.0») в белорусской институциональной системе. Цель исследования заключается в обосновании рекомендаций по трансформации модели предпринимательского университета на основе кластерных отношений. Анализ научных источников и предыдущие монографические исследования автора позволили обосновать необходимость формирования модели предпринимательского университета; рассмотрены формы взаимодействия участников образовательной инициативы, различия в подходах к кластеризации модели предпринимательского университета. Использовались методы литературного обзора, сравнения, сопоставления, аргументации, обобщения. Исходя из особенностей государственного регулирования экономики и взаимодействия субъектов хозяйствования рекомендовано создание предпринимательского университета в виде кластеров субъектов образования, науки и бизнеса на региональном и отраслевых уровнях. Использование институциональной теории и стейкхолдер-менеджмента, проведение SWOT-анализа сценария трансформации модели предпринимательского университета на основе кластерных отношений в результате структурной экономической трансформации обеспечили автору возможность сформулирования рекомендаций по осуществлению структурной трансформации модели предпринимательского университета в белорусской институциональной системе.