В настоящее время совокупность неблагоприятных внешних условий делает особенно актуальной для экономики России проблему развития импортозамещения во многих отраслях, одной из которых является фармацевтика. Производство лекарственных препаратов является не только социально значимым, но и представляет собой существенный компонент системы экономической безопасности государства. В статье исследуется современное состояние фармацевтической отрасли России и причины сохраняющейся высокой доли импортных препаратов на отечественном рынке. Определены основные проблемы развития российской фармацевтики и показана их обусловленность сформированной за несколько десятилетий «колониальной» моделью развития. Раскрываются особенности функционирования отрасли и проблемы повышения независимости производства лекарственных препаратов в России от внешних источников сырья и субстанций, материалов, оборудования и технологий. Анализируются принципы формирования перечня жизненно необходимых и важнейших лекарственных препаратов и на примере группы йодсодержащих препаратов раскрываются причины недостаточной эффективности импортозамещения в фармацевтической отрасли. На примере Иркутской области показано сохраняющееся преобладание препаратов зарубежных производителей на рынке как по препаратам йода, так и в целом по списку жизненно необходимых и важнейших лекарственных препаратов. В статье определены основные направления развития импортозамещения в российской фармацевтике, а также приведены рекомендации по повышению доли отечественных производителей на рынке лекарственных средств.