Публикации автора

Цель: разработка новой модели дифференциации домашней свиньи и дикого кабана, основанной на анализе аутосомальных SNP, что позволяет повысить точность видовой идентификации. Материалы и методы. С использованием биоинформатических алгоритмов SRA-BLAST и GENIS проанализировано 1 639 геномов: 91 дикого кабана (Sus scrofa scrofa) и 1 548 домашней свиньи (Sus scrofa domesticus). Оценён дифференцирующий потенциал исследуемых полиморфизмов и рассчитана модель классификации дикого кабана и домашней свиньи на основе трёх SNP (Sscrofa11.1 (GCF_000003025.6)): rs330419406 (Chr.5:55839440A>G), rs81293059 (Chr.8:52261272C>T) и rs326780270 (Chr.1:265347265A>G, NR6A1). Заключение. Модель показала высокие значения точности (99,84 %), специфичности (100 %) и чувствительности (100 %). Проведена успешная апробация модели на выборке из 95 диких кабанов и 95 домашних свиней, точность классификации составила 100 %. В рамках апробации на материале ДНК дикого кабана и домашних свиней подтвержден высокий дифференцирующий потенциал предложенных полиморфизмов. Из 190 образцов корректно классифицированы 100 %. Поскольку генетическое сходство диких кабанов и домашних свиней достигает 99 %, для надёжной дифференциации их образцов необходимо применять специализированные методы и генетические маркеры, что подчеркивает особую значимость разработанной нами модели в контексте точных научных исследований.