Публикации автора

С начала пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID19), объявленной Всемирной организацией здравоохранения 11 марта 2020 г., прошло более пяти лет. За этот период накопился значительный массив знаний о динамике распространения вируса SARS-CoV-2 и о его эпидемиологических проявлениях. Определены источник возбудителя инфекции, механизм и пути заражения. В результате активных исследований разработаны вируснейтрализующие препараты. Вместе с тем на протяжении пандемии появились новые варианты вируса SARS-CoV-2, содержащие многочисленные мутации в субъединице S1 шиповидного белка, что привело к снижению эффективности многих одобренных вакцин и терапевтических средств на основе моноклональных антител. В связи с этим возникла острая потребность в идентификации новых мишеней для разработки вакцин и препаратов следующего поколения с широким спектром действия, способных эффективно противодействовать всем известным вариантам вируса SARS-CoV-2. В настоящем обзоре представлен анализ перспективных мишеней в субъединице S2 шиповидного белка SARS-CoV-2.

Ботулинический токсин – это один из наиболее опасных биологических токсинов, применяемый в медицине, однако несущий потенциальную опасность в качестве агента биологической угрозы. В данном исследовании проведен комплексный in silico анализ аминокислотной последовательности ботулинического токсина разных серотипов с целью идентификации уникальных пептидных маркеров для специфической детекции методами масс-спектрометрии. Проведение биоинформатического анализа и теоретического протеолиза позволило идентифицировать уникальные пептиды, покрывающие различные функциональные домены ботулинических токсинов. Предложенные маркеры демонстрируют полную специфичность к целевым серотипам ботулотоксинов при анализе в базах данных UniProt и NCBI. Отобранные уникальные пептидные маркеры могут быть использованы при проведении анализа биологических образцов, продуктов питания или объектов окружающей среды на наличие ботулотоксинов методом жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии в режиме множественного мониторинга реакций или методом времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией.