В статье рассматриваются вопросы формирования финансового механизма управления в наукоемких компаниях авиационной промышленности. Обосновано использование экосистемного подхода как элемента теоретическо-методологической основы современных экономических исследований. Представлены различные подходы для интерпретации понятия «экосистема». Показано, что рост экономических показателей деятельности компании, их улучшение, отражает уровень социальной ответственности и возможности обеспечить финансирование социально значимых и экологических проектов. Предложена модель финансового механизма компании на основе экосистемного подхода. Конкретизированы базовые факторы, определяющие основные элементы финансового механизма наукоемких компаний с учетом особенностей деятельности в авиационной промышленности.