Статья посвящена изучению рационалистических сект протестантского типа, которые получили распространение на территории Тобольской губернии в конце XIX — начале XX веков. Проанализированы документы фондов Тобольского государственного архива, публикации в газете «Тобольские епархиальные ведомости», труды представителей православного духовенства. Анализ источников позволил авторам сделать вывод о том, что протестантские секты (штундизм, баптизм, меннонитство и адвентизм) появляются на территории губернии с конца XIX века, а рост числа сектантов в регионе обусловлен изданием законов о началах веротерпимости 1905—1906 годов. Подчеркивается, что распространение рационалистических учений иностранного происхождения было важной тенденцией в развитии религиозного сектантства России в рассматриваемый период. Сделан вывод о том, что губернские и епархиальные представители власти испытывали сложности в отнесении религиозных общин к определенным направлением рационалистических сект, что можно объяснить как многочисленностью толков, так и распространенной среди штундистов, баптистов, меннонитов практики переходов из одного направления в другое. Авторы отмечают, что в целом для местных сибиряков новые учения редко становились привлекательными, а численность сектантов в Тобольской губернии увеличивалась в основном за счет переселенцев из европейской и южной частей России.