Цель работы состояла в оценке возможности применения участка ND5/ND6 мтДНК в качестве полиморфного маркера для дифференциации нельмы на примере двух ремонтно-маточных стад нельма «Кубенская» и нельма «Обская» рыбоводного хозяйства «Форват» Ленинградской области.
Материалы и методы. Материалом для исследования нельмы послужили 60 образцов тканей сеголеток нельмы, собранные в период 2020—2023 гг. на рыбоводном хозяйстве из ремонтно-маточного стада «Кубенская нельма» (n=30) и «Обская нельма» (n=30). Гаплотипирование нельмы проводили по участку ND5/ND6 мтДНК методом ПЦР-ПДРФ на основе полиморфизма сайтов рестрикции эндонуклеазных ферментов и определяли нуклеотидные последовательности секвенированием по Сэнгеру этого участка мтДНК. Данные о нуклеотидной последовательности ND5/ND6 у образцов нельмы из двух выборок получены с помощью генетического анализатора ABI-3500 (Applied Biosystems), последовательности ДНК были отредактированы вручную и выровнены с помощью программного обеспечения MEGA X.
Результаты. Представленные в работе особенности нуклеотидной последовательности ND5/ND6 у представителей рода Stenodus ранее не рассматривались как информативный молекулярно-генетический маркер. Было установлено, что нельма из ремонтно-маточного стада, сформированного от производителей озера Кубенского, демонстрирует генетические отличия от ремонтно-маточного стада нельмы из р. Оби. Проанализированный участок мтДНК может быть применен в качестве молекулярно-генетического маркера при проведении гаплотипирования нельмы на рыбоводных предприятиях в выборках значительного объема для контроля мероприятий по восстановлению географически удаленных природных популяций нельмы.