В разных типах почвы содержится значительное количество видов патогенных и условно патогенных микромицетов, которые способны вызывать вредоносные болезни сельскохозяйственных культур. Поэтому в процессе их возделывания необходимо иметь информацию не только о физико-химических характеристиках почвы, отвечающих потребностям культур, но и о составе микроскопических грибов, заселяющих ее. Целью наших исследований являлось определение разнообразия состава почвенных микроорганизмов, содержащихся в черноземе выщелоченном в районах юго-восточной и восточной части Краснодарского края. Исследования проводили в 2024-2025 гг. в лабораторных условиях отдела селекции рапса и горчицы ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК. Объектами исследования служили микроскопические грибы, содержащиеся в образцах чернозема выщелоченного из разных районов Краснодарского края: ст. Вознесенская Лабинского района (географически расположена в юго-восточной части), г. Армавир (относится к восточной части Краснодарского края). Отборы проб для проведения микробиологического анализа производили на глубине почвы до 20,0 см. Проводили определение обилия рода, пространственной частоты встречаемости рода микромицетов, коэффициенты сходства Серенсена комплексов почвенных микромицетов в разных частях Краснодарского края (по числу родов). В годы исследований родовой состав почвенных микромицетов в почве юго-восточной и восточной части Краснодарского края различался не-значительно. Из образцов почвы юго-восточной части края выделены шесть, восточной части - семь родов грибов. Выявленные микромицеты относились к двум отделам: Ascomycota и Mucoromycota. Наиболее многочисленными по показателю обилия в образцах чернозема выщелоченного всех районов исследования являлись грибы рода Trichoderma (72-76 %). Высокая пространственная частота встречаемости микромицетов в почве юго-восточной и восточной части Краснодарского края наблюдалась у родов Cladosporium, Fusarium, Penicillium и Trichoderma: от 80 до 100 %. Сходство сообществ микроскопических грибов в почве разных частей края высокое: 75-100 %.