В условиях потенциальных чрезвычайных ситуаций и современных требований по снижению экологических рисков для населения требуется выбор наиболее безопасного и эффективного реагента для обеззараживания воды. В статье представлены результаты оценки рисков применения двух реагентов для обеззараживания воды - гипохлорита натрия и диоксида хлора. Анализ проведён с применением реестра и матрицы рисков по таким категориям, как обращение с реагентом, влияние на здоровье персонала, опасность при чрезвычайных ситуациях и вредоносность после очистки воды. Установлено, что доля событий с критическими последствиями и высокой/очень высокой вероятностью для гипохлорита натрия составляет 21 %, для диоксида хлора - 29 %. Гипохлорит натрия предпочтительнее с точки зрения логистики и эксплуатационной простоты (готовый реагент, не требующий синтеза на месте), однако его применение связано с риском образования канцерогенных веществ. Исследования водопроводной воды выявили повышенное содержание остаточного активного хлора, тем не менее расчётный канцерогенный и неканцерогенный риск для здоровья населения соответствуют низкому уровню. Для снижения содержания остаточного хлора и тригалогенметанов рекомендуется применять при обеззараживании комбинацию гипохлорита натрия с ультрафиолетовым излучением. Такой подход, соответствующий наилучшим доступным технологиям, снижает расход реагента, обеспечивает пролонгированный эффект обеззараживания и уменьшает образование хлорорганических соединений.