Статья посвящена исследованию системы преподавания богословия архимандрита Софонии (Сокольского; 1800–1877), впоследствии первого архипастыря Туркестанской епархии, сформировавшуюся ко времени его ректорства в Орловской духовной семинарии (1835– 1839 гг.). Цель исследования — реконструировать богословские взгляды архимандрита Софонии, определить источники и контекст формирования его системы, а также оценить ее место среди богословских исканий эпохи, связанных с именами святителей Филарета Московского и Иннокентия Херсонского. Новизна работы заключается во введении в научный оборот материалов архивной рукописи его «Конспекта семинарского преподавания богословских наук», где ключевой идеей является разделение христианского богословия на «религиозистику» и «екклезиастику» (учение о Церкви). В статье обосновывается, что данный принцип систематизации богословского знания в России второй четверти XIX века мог быть только результатом следования богословской системе святителя Иннокентия (Борисова). Также делается вывод о неверности утверждения о следовании архимандритом Софонией богословским системам архиепископов Иринея (Фальковского) и Сильвестра (Кулябки), и о том, что выпускник семинарии 1837 года Егор Говоров (впоследствии святитель Феофан Затворник) слушал лекции ректора Орловской семинарии архимандрита Софонии, составленные на основе богословия святителя Иннокентия (Борисова). В статье также анализируется отзыв на «Конспект…» Орловского ректора и делается вывод о том, что рецензент, будучи незнаком с богословием святителя Иннокентия, предъявляет претензии не столько системе архимандрита Софонии, сколько самому владыке Иннокентию, учеником которого и является архимандрит Софония.