Статья посвящена комплексному анализу проблем организации тренировочного процесса в студенческом футболе московских вузов. Исследование, проведённое в период с сентября 2022 по май 2025 годы, охватило всех 38 главных тренеров сборных команд участников Московской студенческой спортивной лиги. Методологическую основу составили анкетирование, индивидуальные структурированные беседы, педагогическое наблюдение и методы математической статистики. Выявлено и систематизировано 42 конкретные трудности, объединённые в 12 типологических групп и 4 крупных проблемных блока: организационный, физико-функциональный, технико-тактический и психологический. Наиболее критическими определены несовместимость академического календаря с графиком спортивной подготовки (89,5% респондентов), недостаток средств объективного контроля функционального состояния спортсменов (92,1%), недостаточное владение современными тактическими концепциями (89,5%) и полное отсутствие штатных спортивных психологов (100%). Установлено, что выявленные проблемы образуют взаимообусловленную систему, где организационные ограничения усугубляют методическую неподготовленность тренеров и психологическое напряжение всех участников процесса. Результаты исследования создают научную основу для разработки системных мер по совершенствованию студенческого футбола в образовательных организациях высшего образования.