В XIX в. в России уже существовала клиническая медицина и был предусмотрен комплекс мер, направленных на медико-санитарное обслуживание населения. В новых регионах правительство Российской империи становилось транслятором нового знания о медицине как о всеобщем благе. В условиях отдаленности и отсутствия местной сети аптечных и лечебных учреждений формировалась специфическая структура управления медицинской сферой Туркестанского генерал-губернаторства. В настоящей статье определены основные особенности статуса Туркестана в общеимперском пространстве, касающиеся медико-санитарного обеспечения. Исследование основано на источниках, обнаруженных в фондах Российского государственного военно-исторического архива; корпусе нормативно-правовых источников Полного собрания законов Российской империи. Сделан вывод о том, что для управления медицинской сферой региона была сформирована система военно-народного управления, при которой гражданская сфера, в том числе и медицинская, находилась в руках военного ведомства. Ключевым управленческим звеном в медико-санитарном обеспечении являлось Окружное военно-медицинское управление, а его руководитель был главным медицинским чиновником края.