В условиях конституционной реформы, связанной с внедрением в российскую юридическую практику единства публичной власти в федеративной России, возрастает интерес к субъектам исполнительной власти, являвшимся структурными элементами единой системы и до внесения изменений в Конституцию в 2020 г. В настоящей статье раскрывается принцип единства системы исполнительной власти в механизме обеспечения государственных гарантий в сфере охраны здоровья на федеральном уровне и уровне субъектов Российской Федерации. Выявлены особенности организационного и деятельностного аспектов применительно к институтам исполнительной власти, специфика их взаимодействия с главой государства, представителями исполнительной власти на федеральном уровне, а также гражданского сообщества. Анализу подвергнуты внесенные в российское законодательство изменения, направленные на совершенствование оценки качества оказываемых услуг в сфере охраны здоровья граждан; выявлены проблемы, препятствующие достижению обозначенных в законе показателей в обозначенной сфере. Методологическую базу исследования составили сравнительно-правовой (при выявлении особенностей субординационных начал в системе органов исполнительной власти разных субъектов России), формально-юридический (при определении полномочий рассматриваемых органов на уровне субъектов) методы. Сформулированы предложения, направленные на повышение результативности деятельности институтов исполнительной власти в сфере охраны здоровья. Полученные результаты могут быть использованы при дальнейшем развитии теорий единства публичной власти, прав и свобод человека и гражданина.