В статье проанализированы научные мнения о природе экономического кризиса, его причинах, а также рассмотрены концепции и роль контроллинга на предприятии. Исследование включает анализ основных методов диагностики финансового состояния и раннего предупреждения угрозы банкротства хозяйствующего субъекта. Доказана актуальность применения инновационного подхода к внедрению финансового контроллинга в систему антикризисного управления. Продемонстрированы преимущества и недостатки традиционного, интегрального и стоимостно-ориентированного подходов к диагностике финансового кризиса путем их практического применения для сравнительного анализа текущих состояний двух действующих предприятий. Сделан вывод о недостаточности изолированного применения каждого из методов для объективной и достоверной оценки вероятности банкротства. Сформулирован вывод, что для принятия своевременных грамотных управленческих решений в области использования антикризисных мер целесообразно руководствоваться системным подходом. Определены индикаторы успешности финансово-хозяйственной деятельности предприятий, включающие показатели разных методов, которые комплексно характеризуют финансовое состояние. На практическом примере наглядно определено, что при анализе результирующих значений каждого индикатора как однофакторных критериев невозможно однозначно трактовать вероятность наступления кризисной ситуации. Таким образом, авторами предложена системная диагностика на основе трех рассмотренных подходов в виде модели рейтинговой оценки глубины кризиса на предприятии. Модель основана на ранжировании индикаторов успешности финансово-хозяйственной деятельности по критериям объективности и достоверности расчетов, а также по приоритетности при выполнении задач финансовой диагностики. Таким образом, предложенный подход к антикризисной диагностике можно считать достаточно объективным в связи с тем, что с его помощью решается проблема устранения неоднозначности выводов при использовании каждого из ранее применяемых методов по отдельности.