В условиях кризисных процессов в современном мировом порядке, важным аспектом международных отношений и стабильности бюджетной системы России является наполнение доходной части федерального бюджета за счёт взыскания таможенных платежей. Вместе с этим, на фоне изменения структуры внешней торговли важным является баланс таможенно-тарифной политики России. Определённое экономическое и стратегическое значение имеет внешнеторговой оборот продовольственных товаров, являясь индикатором экономической активности России. С целью рассмотрения процесса не только в рамках большой системы, но и отдельных элементов, исследование осуществлялось на уровне страны и Южного федерального округа. Целью научной статья является статистическая оценка взаимосвязи динамики таможенных платежей с объёмами внешней торговли продовольственными товарами и сельскохозяйственного сырья. К задачам статьи следует отнести анализ изменения объёмов таможенных платежей и объёмов экспорта и импорта продовольственных товаров, оценка развития внешней торговли и корреляции между таможенными платежами и рассматриваемых товарных потоков. По итогам исследования установлено наличие существенной взаимосвязи видов таможенных платежей, администрируемых таможенными органами России с показателями внешнеторговых товаропотоков продовольственных товаров.