Проведённое исследование направлено на применение комплекса методов с целью доказательной оценки влияния внешних и внутренних факторов на инвестиционно-инновационное развитие сельского хозяйства Ростовской области и Краснодарского края (Азово-Черноморского края). Анализ методов оценки показал, что в экономической литературе существует множество количественных и качественных методов, которые применимы на различных уровнях экономики. Однако, наибольшего эффекта от заданной оценки возможно достичь при комплексном применении существующих методов. В данной статье проанализированы статистические данные Азово-Черноморского края. Применяя качественные методы оценки влияния внешних и внутренних факторов на инвестиционно-инновационное развитие, были отобраны зависимая переменная и регрессоры для линейной регрессионной модели. В ходе эксперимента предложена линейная регрессионная модель, позволяющая оценить влияние внешних и внутренних факторов на инвестиционно-инновационное развитие сельского хозяйства Азово- Черноморского края. Построена корреляционная матрица в Microsoft Excel. Регрессионная модель была скорректирована посредством МНК в прикладном программном пакете для эконометрического моделирования Gretl и подвержена проверочным тестам корректности модели линейной регрессии. Сделаны выводы о качестве влияния отобранных регрессоров модели на инновационно-инновационное развитие Азово-Черноморского края.