В статье рассмотрена структура мусульманской уммы Башкортостана через анализ религиозных групп (джамаатов), генезиса и специфики их социальной организации, ориентации религиозной догматики, отношения к государству и друг к другу; представлено деление на просуфийские (хакканиты, сулейманджилар, тарикат Шизали, тарикат Осман Топбаша, хабашиты, Бата, а также признанные экстремистскими Таблиг-джамаат, Орда и Нурджулар) и просалафитские религиозные группы («Шура мусульман Башкортостана», мадхалиты, а также запрещенные российским законодательством Хизбу-т-Тахрир и отдельные экстремистские группы джихадистов). Выявлена дифференциация мусульманской уммы Башкортостана. Ее причинами являются кризис этнонациональной парадигмы в начале XXI в. и переход национально-ориентированной молодежи, общественников и интеллектуалов в мусульманский сегмент. В Башкортостане единственным традиционным мусульманским институтом является система муфтиятов: Центральное духовное управление мусульман (ЦДУМ) России и Духовное управление мусульман Республики Башкортостан (ДУМ РБ), которые в равной степени утвердились в общественном историческом сознании. Возможно, именно в рамках этих двух организаций нужно решать вопросы, связанные с преодолением внутриконфессиональной конфликтности