В статье проводится комплексное исследование концептуальных основ использования геоинформационных систем (ГИС) в управлении особо охраняемыми природными территориями (ООПТ) Российской Федерации. В ходе работы выявлены текущие практики и ключевые тенденции применения ГИС на различных ООПТ, с акцентом на Северо-Кавказский федеральный округ (СКФО). Исследование включает разработку программы внедрения ГИС, адаптированной под масштабы и особенности профильных задач охраняемых территорий региона. Представлены обоснования предполагаемой эффективности и ожидаемых затрат на внедрение ГИС для различных категорий ООПТ. Внедрение NextGIS на ООПТ СКФО повысит точность экологического мониторинга и снизит затраты на полевые исследования, управление данными и поддержание природных ресурсов. Это позволит значительно улучшить качество охраны природы и повысить устойчивость экосистем региона.