ЭКОСИСТЕМЫ

Секвенирование методом «дробовика» применено для определения маркерных возможностей участка ДНК гена, кодирующего 16S рРНК малой субъединицы бактериальной рибосомы. Определен таксономический состав бактериального метагенома в кишечнике медоносных пчел (Apis mellifera L.) Крыма. В кишечниках всех проанализированных пчел присутствует облигатное ядро, состоящее из 7 основных родов домена бактерий, относящихся к 4 типам, 5 классам, 6 порядкам и 6 семействам. Наибольшей долей видов в ядре метагенома бактерий представлено семейство Orbaceae. Наибольшим числом видов в этом семействе обладают роды Gilliamella и Frischella - 39,8 и 20,4 % видов соответственно. Вторую позицию с очень близкими долями видов занимают роды Snodgrassella и Lactobacillus (соответственно 1,9 и 13,0 % видов). В третью группу родов вошли рода Bartonella и Bifidobacterium, с 5,8 и 2,21 % видов, соответственно. Замыкает список род Commensalibacter с долей менее одного процента видов (0,4 %). На основе литературных данных составлен список видов, относящихся к соответствующим семи родам. На основании анализа литературных источников установлено, что в мероконсорцию метагенома A. mellifera с семью родами входит минимум по одному виду. Исключение составляют род Bifidobacterium, он представлен тремя видами, и род Lactobacillus - семью. Таксоны домена архебактерий представлены 1 типом, 1 классом, 2 порядками, 2 семействами и 3 родами. Однако, их доля в метагеноме не превышала сотые доли процента. Таким образом, можно считать эти бактерии случайным компонентом, не характерным для кишечного микробиома A. mellifera.