Публикации автора

Характеристика генома штамма Stutzerimonas stutzeri, выделенного из нефтезагрязненной почвы Татарстана

Разливы нефти в результате антропогенной деятельности, такой как добыча, транспортировка или хранение нефтепродуктов, наносят серьезный вред биосфере и потенциально опасны для здоровья человека. Биоремедиация с использованием микроорганизмов является перспективной технологией очистки таких загрязненных участков, поскольку она экономически эффективна и приводит к полной минерализации вредных соединений. Обнаружение новых, способных к эффективной биодеградации нефти местных штаммов микроорганизмов, дает перспективу для создания надежной и экономичной стратегии рекультивации нефтезагрязненных почв. В работе представлены данные по определению и анализу нуклеотидной последовательности полного генома штамма DIA-8, выделенного из нефтезагрязненной почвы на территории Республики Татарстан. В ходе аннотации кодирующих последовательностей полного генома выявлен ряд генов, кодирующих белки, ответственные за катаболизм ароматических соединений. Показана принадлежность штамма к виду Stutzerimonas stutzeri. В геноме штамма S. stutzeri DIA-8 показано присутствие ключевого гена орто-расщепления катехолов – катехол-1,2-диоксигеназы, а также обнаружены гены, участвующие в синтезе гликолипидных биосурфактантов и устойчивости к тяжелым металлам. Аннотация генома показала, что данный штамм имеет низкий патогенный потенциал, сравнимый с невирулентными представителями рода Pseudomonas, что дает возможность использовать его в качестве биотехнологического продукта. Секвенированная нуклеотидная последовательность генома депонирована в международную базу данных GenBank под номером GCA_037081755.1.

Издание: ВЕСТНИК ТОМСКОГО ГОСУДАРСТВЕННОГО УНИВЕРСИТЕТА
Автор(ы): Бабынин Эдуард Викторович
Сохранить в закладках
ВЛИЯНИЕ ФОСФАТОВ И БЕЛОГО ФОСФОРА НА КИСЛОТНОСТЬ КУЛЬТУРАЛЬНОЙ СРЕДЫ (2024)

Способность биоты существовать в присутствии такого вещества, как белый фосфор, сама по себе удивительна. Даже если речь идет о таком жизнестойком организме, как черный аспергилл. Но белый фосфор не только обладает экстремальной токсичностью. Культивирование микроорганизмов на нем в качестве единственного источника биогенного элемента исключает возможность внесения в культуральную среду фосфатов. А они играют важнейшую роль в качестве кислотно-основных буферных систем, стабилизирующих значения рН в области, благоприятной для роста. С этой проблемой приходится сталкиваться при исследовании биодеградации любого вещества, содержащего фосфор в своем составе. Это явление усугубляет токсическое воздействие белого фосфора и ряда соединений данного элемента. Поэтому представленное исследование посвящено сравнению значений рН сред с белым фосфором и смесью гидрофосфата и дигидрофосфата калия - классическим источником фосфора. Причем сравнивались как свежеприготовленные среды, так и после культивирования Aspergillus niger в течение недели. Оказалось, что выбор источника фосфора действительно влияет на рН среды - среда с белым фосфором всегда имеет более высокую кислотность. Но различия нельзя назвать резкими. Вероятно, токсические свойства белого фосфора сильнее влияют на жизнедеятельность аспергилла, чем значения рН культуральной среды.

Издание: ЭКОЛОГИЧЕСКИЙ ВЕСТНИК СЕВЕРНОГО КАВКАЗА
Выпуск: Т. 20 № 1 (2024)
Автор(ы): Миндубаев Антон Зуфарович, Бабынин Эдуард Викторович
Сохранить в закладках
ВЛИЯНИЕ БЕЛОГО ФОСФОРА И ФОСФАТОВ НА рН КУЛЬТУРАЛЬНОЙ СРЕДЫ (2024)

Представленное исследование посвящено сравнению значений рН сред с белым фосфором и смесью гидрофосфата и дигидрофосфата калия – классическим источником фосфора. Оказалось, что выбор источника фосфора действительно влияет на рН среды, среда с белым фосфором всегда имеет более высокую кислотность. Но различия нельзя назвать резкими. Вероятно, токсические свойства белого фосфора сильнее влияют на жизнедеятельность аспергилла, чем значения рН культуральной среды.

Издание: НАУЧНЫЙ ВЕСТНИК АРКТИКИ
Выпуск: № 17 (2024)
Автор(ы): Миндубаев Антон Зуфарович, Бабынин Эдуард Викторович
Сохранить в закладках