Разливы нефти в результате антропогенной деятельности, такой как добыча, транспортировка или хранение нефтепродуктов, наносят серьезный вред биосфере и потенциально опасны для здоровья человека. Биоремедиация с использованием микроорганизмов является перспективной технологией очистки таких загрязненных участков, поскольку она экономически эффективна и приводит к полной минерализации вредных соединений. Обнаружение новых, способных к эффективной биодеградации нефти местных штаммов микроорганизмов, дает перспективу для создания надежной и экономичной стратегии рекультивации нефтезагрязненных почв. В работе представлены данные по определению и анализу нуклеотидной последовательности полного генома штамма DIA-8, выделенного из нефтезагрязненной почвы на территории Республики Татарстан. В ходе аннотации кодирующих последовательностей полного генома выявлен ряд генов, кодирующих белки, ответственные за катаболизм ароматических соединений. Показана принадлежность штамма к виду Stutzerimonas stutzeri. В геноме штамма S. stutzeri DIA-8 показано присутствие ключевого гена орто-расщепления катехолов – катехол-1,2-диоксигеназы, а также обнаружены гены, участвующие в синтезе гликолипидных биосурфактантов и устойчивости к тяжелым металлам. Аннотация генома показала, что данный штамм имеет низкий патогенный потенциал, сравнимый с невирулентными представителями рода Pseudomonas, что дает возможность использовать его в качестве биотехнологического продукта. Секвенированная нуклеотидная последовательность генома депонирована в международную базу данных GenBank под номером GCA_037081755.1.
Способность биоты существовать в присутствии такого вещества, как белый фосфор, сама по себе удивительна. Даже если речь идет о таком жизнестойком организме, как черный аспергилл. Но белый фосфор не только обладает экстремальной токсичностью. Культивирование микроорганизмов на нем в качестве единственного источника биогенного элемента исключает возможность внесения в культуральную среду фосфатов. А они играют важнейшую роль в качестве кислотно-основных буферных систем, стабилизирующих значения рН в области, благоприятной для роста. С этой проблемой приходится сталкиваться при исследовании биодеградации любого вещества, содержащего фосфор в своем составе. Это явление усугубляет токсическое воздействие белого фосфора и ряда соединений данного элемента. Поэтому представленное исследование посвящено сравнению значений рН сред с белым фосфором и смесью гидрофосфата и дигидрофосфата калия - классическим источником фосфора. Причем сравнивались как свежеприготовленные среды, так и после культивирования Aspergillus niger в течение недели. Оказалось, что выбор источника фосфора действительно влияет на рН среды - среда с белым фосфором всегда имеет более высокую кислотность. Но различия нельзя назвать резкими. Вероятно, токсические свойства белого фосфора сильнее влияют на жизнедеятельность аспергилла, чем значения рН культуральной среды.
Представленное исследование посвящено сравнению значений рН сред с белым фосфором и смесью гидрофосфата и дигидрофосфата калия – классическим источником фосфора. Оказалось, что выбор источника фосфора действительно влияет на рН среды, среда с белым фосфором всегда имеет более высокую кислотность. Но различия нельзя назвать резкими. Вероятно, токсические свойства белого фосфора сильнее влияют на жизнедеятельность аспергилла, чем значения рН культуральной среды.