Фрагментация ДНК в сперматозоидах млекопитающих и методы ее исследования (обзор) (2024)
Цель: систематизирование и анализ научной информации о фрагментации ДНК сперматозоидов сельскохозяйственных животных и методах ее исследования.
Не так давно был обнаружен один из факторов, негативно влияющих на фертильность самцов-производителей - фрагментация ДНК сперматозоидов. Многочисленными исследованиями установлено, что фрагментация ДНК — это разрыв нитей ДНК на части. По мнению Agarwal A. (2003), фрагментация ДНК сперматозоидов является наиболее частым нарушением ультраструктуры сперматозоидов. По данным Baumber J. с соавт. (2003) определение фрагментации ДНК сперматозоидов в настоящее время является одним из современных методов оценки качества спермы. Многочисленными исследованиями сформирован пул данных о факторах, вызывающих фрагментацию ДНК в сперматозоидах. Так, Baumber J. с соавт. (2003) своих исследованиях указывает на то, что причиной фрагментации ДНК могут быть проблемы с ремоделированием хроматина, апоптозом и окислительными процессами в сперме. Исследованиями, проведенными Абонеевым В. В. с соавтор. (2021) установлено, что при тяжелых формах патозооспермии количество сперматозоидов с фрагментированной ДНК выше, чем при менее выраженных нарушениях сперматогенеза [24]. Появление аномальных и малоподвижных сперматозоидов в эякуляте является одним из косвенных маркеров повышения индекса фрагментации ДНК в сперматозоидах, что негативно отражается на оплодотворяющей способности спермы. В связи с этим исследование фрагментации ДНК сперматозоидов является эффективным диагностическим методом определения фертильности. Учитывая некоторые патофизиологические аспекты, приводящие к фрагментации ДНК, определение индекса данного процесса априори не может быть рутинным. В настоящее время активно используются такие высокоточные методы как TUNEL (terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling) – маркировка концов разорванной молекулы, SCSA (Sperm Chromatin Structure Assay) – исследование дисперсии хроматина сперматозоидов, Comet (Single-cell gel electrophoresis assay, Cometassay) – способен выявить разрывы в одиночных клетках, SCD (Sperm Chromatin Dispersion test) – тест на дисперсию хроматина и др.
Идентификаторы и классификаторы
Фрагментация ДНК представляет собой разрыв нитей ДНК на части. По данным Agarwal A. (2003), фрагментация ДНК сперматозоидов является наиболее частым нарушением
ультраструктуры сперматозоидов, которое представляет собой разрывы в одной или сразу в
двух цепях ДНК[1].
Список литературы
- Agarwal A. Role of sperm chromatin abnormalities and DNA damage in male infertility / A. Agarwal, T. M. Said // Hum Reprod Update. – 2003. – ‹ 9(4). – ê. 331–45. Doi: 10.1093/humupd/dmg027.
- Kumar K. Predictive value of DNA integrity analysis in idiopathic recurrent pregnancy loss following spontaneous conception / K. Kumar, D. Deka, A. Singh et al. // J Assist Reprod Genet. – 2012. – ‹ 29(9). – P. 861–867. Doi: 10.1007/510815-012-9801-3.
- Castro L. S. Effect of bovine sperm chromatin integrity evaluated using three different methods on in vitro fertility / L. S. Castro, A. F. P. Siqueira, T. R. D. S. Hamilton, C. M. Mendes, J. A. Visintin,
M. E. O. A. Assumpcao // Theriogenology. (2018) 107:142–8. Doi: 10.1016/j.theriogenology.2017.11.006. - Baumber J. Reactive oxygen species and cryopreservation promote DNA fragmentation in equine spermatozoa / J. Baumber, B. A. Ball, J. J. Linfor, S. A. Meyers // J Androl. – 2003. – ‹ 24. – ê. 621– 628. Doi: 10.1002/j.1939-4640.2003.tb02714.x.
- Gonzalez-Marin C. Types, causes, detection and repair of DNA fragmentation in animal and human sperm cells / C. Gonzalez-Marin, J. Gosalvez, R. Roy // Int J Mol Sci. – 2012. – ‹ 13. – 14026–14052. Doi: 10.3390/ijms131114026.
- Evenson D. P. Relationships between the age of 25,445 men attending infertility clinicsand sperm chromatin structure assay (SCSA®) defined sperm DNA and chromatin integrity / D. P. Evenson, G. Djira, K. Kasperson, J. Christianson // Fertil Steril. – 2020. – ‹114(2). – ê. 311–320. Doi: 10.1016/j.fertnstert.2020.03.028.
- Kadioglu A. The role of sperm DNA testing on male infertility / A. Kadioglu, M. Ortac // TranslAndrol Urol. – 2017. – ‹ 6. – ê. 600. Doi: 10.21037/tau.2017.03.82.
- Kumaresan A. Sperm viability, reactive oxygen species, and DNA fragmentation index combined can discriminate between above-and below-average fertility bulls / A. Kumaresan, A. Johannisson, E. M. Al-Essawe, J. M. Morrell // J Dairy Sci. – 2017. – ‹ 100. – P. 5824–5836. Doi: 10.3168/jds.2016-12484.
- Cande C. Apoptosis-inducing factor (AIF): caspase-independent after all / C. Cande, N. Vahsen, C. Garrido // Cell Death Differen. – 2004. – ‹ 11. – ê. 591–595. Doi: 10.1038/sj.cdd.4401400.
- Fortes M. R. S. Sperm protamine deficiency correlates with sperm DNA damage in Bos Indicus bulls / M. R. S. Fortes, N. Satake et al. // Andrology. – 2014. – ‹ 2. – ê. 370–378. Doi: 10.1111/j.2047- 2927.2014.00196.x.
- Gajski G. Application of the comet assay for the evaluation of DNA damage in mature sperm / G. Gajski, S. Ravlic et al. // Mutation Research-Reviews in Mutation Research. – 2021.– ê. 788. Doi: 10.1016/j.mrrev.2021.108398.
- Hamilton T., de Castro L. S. et al. Induced lipid peroxidation in ram sperm: semen profile, DNA fragmentation and antioxidant status, M. E. O. d’Avila Assumpcao, 2016.
- Hirsh A. Male subfertility / A. Hirsh // BMJ. – 2003. – ‹ 327. – ê. 669–672. Doi: 10.1136/bmj.327.7416.669.
- Lewis S. E. The impact of sperm DNA damage in assisted conception and beyond: recent advances in diagnosis and treatment / S. E. Lewis, R. J. Aitken et al. // Reprod Biomed Online. – 2013. – ‹ 27. – ê. 325–337. Doi: 10.1016/j.rbmo.2013.06.014.
- Lopez-Fernandez C. Dynamics of Sperm DNA Fragmentation in Domestic Animals: II. The Stallion / C. Lopez-Fernandez, F. Crespo et al. // Theriogenology. – 2007. – ‹ 68. – ê. 1240–1250.
- Schulte R. T. Sperm DNA damage in male infertility: etiologies, assays, and outcomes / R. T. Schulte, D. A. Ohl, M. Sigman, G. D. Smith // J Assist Reprod Genet. – 2010. – ‹ 27. – P. 3–12. Doi:
10.1007/s10815-009-9359-x. - Pena F. J. Redox regulation and oxidative stress: the particular case of the stallion spermatozoa / F. J. Pena, C. O’Flaherty et al. // Antioxidants. – 2019. – ‹ 8. – ê. 67. Doi: 10.3390/antiox8110567.
- Kuchakulla M., Narasimman M. et al. How defective spermatogenesis affects sperm DNA integrity / M. Kuchakulla, M. Narasimman et al. // Andrologia. – 2020. – e13615. Doi: 10.1111/and.13615.
- Peris-Frau P. Comparative evaluation of DNA integrity using sperm chromatin structure assay and Sperm- Ovis-Halomax during in vitro capacitation of cryopreserved ram spermatozoa / P. Peris-Frau, M. Alvarez- Rodriguez et al. // Reprod Domestic Anim. – 2019. – ‹ 54. – ê. 46–49. Doi: 10.1111/rda.13519.
20 Ram. C. LopezFernandez, J. L. Fernandez at al. Dynamics of sperm DNA fragmentation in domestic animals III. LessPublished in Theriogenology, 2008. - Tesarik J. Late, but not early, paternal effect on human embryo development is related to sperm DNA fragmentation / J. Tesarik, E. Greco, C. Mendoza // Hum Reprod. – 2004. – ‹ 19. – ê. 611–615. Doi: 10.1093/humrep/deh127.
- Thippeswamy V. B. Effects of pedigree and exotic genetic inheritance on semen production traits of dairy bulls / V. B. Thippeswamy, S. S. Layek et al. // Asian Pacific J Reprod. – 2014. – ‹ 3. – ê. 13–17. Doi: 10.1016/S2305-0500(13)60178-5.
- Vince S., Zaja I. et al. Age-related differences of semen quality, seminal plasma, and spermatozoa antioxidative and oxidative stress variables in bulls during cold and warm periods of the year. less Published in Animal, 2017.
Выпуск
Другие статьи выпуска
В данной статье представлены результаты исследования адаптивных изменений волосяного покрова у лошадей якутской породы разных популяций, которые способствуют повышению теплоизоляционных качеств в зимний период. В исследовании было обнаружено, что лошади момской популяции в период сильных холодов имеют наиболее высокие значения массы зимних волос на 1 см2 кожи (0,107 г) по сравнению с амгинской (0,070 г). В первый год жизни лошадей рост волос происходит наиболее интенсивно, и к возрасту 6 месяцев длина волос достигает взрослых значений. У момских лошадей длина волос составляет 37,5±0,5 мм, а у амгинских - 46,0±0,68 мм. Длинные зимние волосы имеют адаптивное значение для жеребят обеих популяций. Летом средняя длина волос у амгинских жеребят составляет 5,54±0,04 мм, а у момских - 6,0±0,8 мм. В первую зиму у якутских лошадей наблюдается интенсивный рост волос, и количество волос на 1 см2 кожи достигает значений 1443±108 шт/см2 у амгинских и 1812± 27 шт/см2 у момских жеребят. Летом у момских жеребят наблюдаются самые толстые волосы с диаметром около 53,4±1,40 мкм, а у амгинских жеребят - 53,1±1,0 мкм. Зимой молодняк из Момского улуса имеет абсолютные показатели толщины волос, превышающие показатели молодняка из Амгинского улуса. Зимой самые тонкие волосы наблюдались у амгинского молодняка - 55,3±1,2 мкм, а у момского - 57,9±1,31 мкм. В целом, эти результаты подтверждают высокую теплоизоляционную способность шерстного покрова у якутских лошадей, что является адаптацией к холодному климату.
Цель: установить показатели кардиогемодинамических значений и проанализировать их у коров джерсейской породы.
Материалы и методы. Опыт проводили на клинически здоровых коровах джерсейской породы (n=70). Все исследованные коровы содержались в одинаковых условиях. Все исследования на животных проводились с-з «Рязанский», Рязанский район, Рязанская область, д. Хирино ООО «Авангард». В нашем исследовании для измерения и дальнейшего анализа показателей центральной и периферической гемодинамики мы использовали аппаратно-программный комплекс неинвазивного исследования центральной гемодинамики методом объемной компрессионной осциллометрии КАП ЦГосм-«Глобус» (анализатор показателей кровообращения осциллометрический). Измерение проводили на хвостовой артерии у клинически здоровых коров джерсейской породы.
Результаты. У коров джерсейской породы в ходе исследования получили средние числовые значения миокардиально-гемодинамических показателей: разные виды артериального давления, сосудистые характеристики и показатели сердечной деятельности. При математическом анализе показателtq гемодинамики установили породные особенности коров джерсейской породы. В связи с этим оценку этих пара- метров целесообразно включить в базовый набор комплекса методик диагностики заболеваний сердца у крупного рогатого скота. Изучение сердечно-сосудистой системы имеет большое значение в ветеринарной лечебно-профилактической работе.
Цель: изучение репаративных процессов и иммунных механизмов в тканях печени крыс на фоне нагрузки водными экстрактами ежевики и пижмы обыкновенной и индуцированном оксидативном стрессе.
Материалы и методы. В эксперименте использовано 120 крыс. Согласно групповой принадлежности животные получали водные экстракты пижмы обыкновенной и ежевики в дозе 50 мг/100г массы животного, объемом 1,5 мл в ежедневно течение 30 дней, а животные контрольной группы – в том же режиме дистиллированную воду. Начиная с 30 суток опыта крысам, параллельно с введением растительных экстрактов, делали инъекции масляного раствора тетрахлорметана в течение 6 суток в дозе 2 г/кг веса животного. На 37 сутки опыта у животных брали кровь, а затем убивали в соответствии с этическими нормами. Из тканей печени изготавливали гистологические препараты и производили подсчет количества синусоидальных клеток. Содержание цитокинов в гомогенатах печени и плазме крови крыс определяли методом иммуноферментного анализа с использованием прибора Lazurite Automated ELISA System.
Результаты. При возникновении оксидативного стресса в плазме крови наблюдается усиленная выработка провоспалительного цитокина TNFα и подавление продукции IL-10, при этом концентрация провоспалительных цитокинов IL-6 и IL- 18 изменяется не существенно. При этом в ответ на диффузное токсическое повреждение печени и возникновение оксидативного стресса в тканях печени отмечается увеличение концентрации цитокинов IL- 1α, IL-18, TNFα, IL-10 и снижение концентрации IL-6, IFNγ, TGF-β. Повышенная продукция IL-1α и IL-18 в тканях печени, по-видимому, запускает локальное воспаление, повышая уровни таких цитокинов как TNFα, IL-6. Повышение концентрации противовоспалительного цитокина IL-10 подтверждает
ключевую роль данного медиатора в регуляции иммунного ответа и способность подавлять секрецию провоспалительных цитокинов TNFα и IL-6.
Заключение. Водные экстракты пижмы и ежевики в разной степени модулируют функциональное состояние синусоидальных клеток в ранние сроки токсического воздействия тетрахлорметаном, что способствует скорейшему разрешению воспалительного процесса. Воздействие водных экстрактов пижмы и ежевики на синусоидальные клетки изменяет продукцию регуляторных факторов, что компенсирует скорость восстановительных процессов после токсического воздействия.
Цель: изучение закономерностей белкового обмена высокоудойных коров в зависимости от периода лактации при привязном и беспривязном способах содержания животных в условиях Европейского Севера России.
Материалы и методы. Биохимические исследования проводились с целью определения белкового профиля животных на базе лаборатории биохимии и физиологии животных с использованием оборудования центра коллективного пользования «Центр сельскохозяйственных исследований и биотехнологий» ФГБУН ВолНЦ РАН. Объектом исследования являлись коровы черно-пестрой голштинизированной породы продуктивностью свыше 8500 кг по хозяйству. При подборе групп подопытных животных учитывали физиологическое состояние, стадию полового цикла и способ содержания. Всего в опыте участвовало 108 коров. Кровь отбирали из хвостовой вены в утренние часы перед кормлением. Условия кормления и содержания соответствовали породным особенностям животных и обеспечивали развития высоких показателей продуктивности. Для оценки состояния белкового обмена определялось в сыворотке крови содержание: общего белка, альбуминов, альфа 1 глобулинов, альфа 2 глобулинов, бета глобулинов, гамма глобулинов, белкового индекса (соотношение альбуминов к глобулинам). Материалом для исследования являлась сыворотка крови. Всего было исследовано 108 образцов.
Результаты. Концентрация общего белка в сыворотке крови опытных животных находится в довольно постоянных пределах, и отклонение составляет от 1 до 5 % ниже установленной нормы в течение физиологического цикла в исследуемых группах животных. Установлена связь между содержанием общего белка и белковых фракций в сыворотке исследуемых животных и способом содержания. Так, показатели общего белка, белковый индекс и альбумины при привязном способе содержания выше, чем при беспривязном способе содержания во все периоды лактации. Максимальная разница выявлена в период после отела (1-100 дней лактации) по содержанию общего белка и гамма глобулинов и составила 5 %. Наименьшая зависимость показателей белкового профиля от способа содержания выявлена у животных в период сухостоя. Уровень общего белка составил 8,0 и 7,99 г%, содержание альбуминов 3,07 и 3,04 г%, белковый индекс 0,6 и 0,58, при привязном и беспривязном способе содержания, соответственно.
Цель: изучение влияния новых кормовых добавок на биохимические показатели крови и воспроизводственную способность коров симментальской породы в Якутии.
Материалы и методы. Исследования проводились на базе ООО «Хоробут» Мегино-Кангаласского района Республики Саха (Якутия) в молочном репродукторе «Эрэл». Животные в летнее время паслись на естественных пастбищах в сельскохозяйственном хозяйстве, а зимой содержались в молочном репродукторе на привязи. Продолжительность научно-хозяйственного опыта составила 238 дней. Животных разделили на 3 группы по 10 голов в каждой, учитывая их возраст и живую массу. Содержание животных в группах было одинаковым. Кормление проводилось дважды в день. В стойловый период животные всех групп получали сбалансированный рацион в соответствии с детализированной системой кормления. Все группы содержались в однотипных условиях, с одинаковым рационом. Болюс для сухостойных коров вводили с помощью специального аппликатора. Рационы для подопытных групп были одинаковы по основным питательным веществам. Для оценки состояния организма животных в течение опыта проводилось исследование биохимии крови, включая содержание форменных элементов и микро-макроэлементов.
Результаты. Анализ данных не выявил статистически значимых изменений в биохимических показателях крови в течение опытов. Все изучаемые параметры крови у всех групп животных оставались в пределах физиологических норм как в начале, так и в конце эксперимента. Результаты анализа проб показали повышение уровня общего белка у исследованных животных в течение опыта. Хотя статистически значимых различий между группами не обнаружено, отмечается лишь повышение уровня белка в I-опытной группе, в то время как в контрольной и во второй группах этот показатель оставался стабильным на протяжении всего эксперимента. Таким образом, применение новых кормовых добавок для сухостойных коров позволит корректировать обмен веществ и предотвращать продукционные нарушения в их организме.
Фертильность коров как способность производить потомство имеет базовое значение для оптимизации воспроизводства стада в молочном скотоводстве. С ростом величины удоя у современных коров до 8–10 тыс. кг молока и более ухудшаются их репродуктивные способности. Фертильность коров является сложным признаком, характеризуется многими показателями и обусловлена комплексом факторов.
Цель: выявление и характеристика ассоциаций показателей фертильности, их взаимосвязь, зависимость от уровня удоя у коров айрширской породы.
Материалы и методы. Исследования проводили на коровах айрширской породы племенного завода «Мегрега» (Республика Карелия). Средний удой на корову составляет свыше 9000 кг молока в год. Показатели фертильности учтены за 5 лет по данным 3866 лактаций. Анализировали взаимосвязи этих показателей и их ассоциаций с величиной удоя.
Результаты. Возраст коров не оказал существенного влияния на параметры фертильности. Моделирование отбора по уровню удоя в текущую лактацию показало существенное ухудшающее влияние более высокого удоя на репродуктивные признаки. Повышение величины удоя коров от 5000 до 10000 кг молока и более сопровождалось увеличением у них индифференс-периода (ИП) на 38,4; периода осеменения (ПО) – на 50,5; сервис-периода (СП) – на 88,9 дня; индекса осеменения (ИО) – с 1,25 до 2,27; ранней эмбриональной гибели (РЭГ) – с 3,1 до 13,3 % (P<0,001); оплодотворяемость от первого осеменения (ОПО) снизилась с 78,1 до 33,6 %. Оптимальным периодом для проведения осеменения после отела высокопродуктивных коров является 100–120 дней. Установлена положительная корреляция между величиной удоя и продолжительностью ИП (r = + 0,11–0,18, Р<0,001).
Заключение. Полученные результаты могут быть использованы в дальнейших исследованиях по разработке селекционных индексов, селекция по которым может обеспечить высокий генетический тренд по удою при сохранении и развитии прогрессирующей плодовитости молочных коров.
Цель: поиск мононуклеотидных полиморфизмов гена-кандидата G0S2, участвующего в метаболизме липидов, и изучение их связи с содержанием абдоминального жира и массы тела у кур бройлеров.
Материалы и методы. В экспериментах использованы 150 бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» в возрасте 35 дней из частного фермерского хозяйства (2015 года). Для секвенирования использовались куры породы пушкинская (23 особи) в возрасте 475 дней, содержащихся на базе биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ «Генетическая коллекция редких исчезающих пород кур» (г. Пушкин, Санкт-Петербург). Выявление мононуклеотидных полиморфизмов гена G0S2 проводилось методом секвенирования участков, содержащих кодирующие и регуляторные последовательности. Генотипирование методом амплификации для апробации тест систем проводилось на приборе Thermal Cycler T100 (Bio-Rad, США).
Результаты. С помощью секвенирования регуляторной области гена G0S2 выявлены два мононуклеотидных полиморфизма: rs29005090(A/ G) и rs317858728 (A/ G), а также достоверное (AG,AA,GG) замены rs29005090 на изучаемые признаки. Мононуклеотидная замена rs29005090 относится к мажорной, поскольку эффект замещения аллелей составляет более 0,6–1,5 сигмы. Генотип GG rs29005090 может быть рекомендован для селекции с помощью маркеров для увеличения привесов птицы и уменьшения абдоминального жира тушки курицы в мясном птицеводстве. При проведении дисперсионного анализа данных для расчета эффекта замещения аллелей маркера мононуклеотидной замены rs317858728 (A/ G) с признаками масса птицы и масса абдоминального жира бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» было выявлено достоверное различие между генотипами AA-GG для признака масса птицы и для признака масса абдоминального жира. Наибольшие показатели по массе тела и массе абдоминального жира наблюдались у кур с генотипом GG. Данная мононуклеотидная замена считается мажорной в отношении признака «абдоминальный жир», поскольку стандартное отклонение составляет более одной сигмы.
Цель: проанализировать нуклеотидное разнообразие фрагмента гена цитохромоксидаза субъединицы 1 мт ДНК в азиатских и американских популяциях нерки.
Материалы и методы. Материалом для анализа являются нуклеотидные последовательности как полученные автором для популяции нерки р.Ола, так и для ряда азиатских и американских популяций нерки, размещенные в Генетическом Банке (www.ncbi.nlm.nih.gov). Проанализировано 139 секвенсов, унифицированное количество нуклеотидов - 640. Статистические параметры следующие: ps – доля полиморфных сайтов, θ – доля полиморфных сайтов с учетом числа сайтов (i) ps/a1, a1 = 1/ Σ1/i, = 1/ 1 + ½ + 1/3+ …+1/i, πT -нуклеотидное разнообразие, πs – среднее нуклеотидное разнообразие внутри популяции, δST – межпопуляционное нуклеотидное разнообразие, NST – коэффициент нуклеотидной дифференциации NST = δST/ πT. Дендрограмма построена по величинам так называемых р-дистанций, метод кластеризации UPGMA.
Результаты. Нуклеотидное разнообразие нерки р. Ола (πT = 0,00505 (s=0,000080)) оказалось несколько выше чем в американских популяциях (πT =0,00403 (s=0,000002)). Коэффициент нуклеотидной дифференциации NST и количество полиморфных сайтов в азиатских популяциях выше, чем в американских. Благодаря этому обнаружен более высокий уровень нуклеотидного разнообразия в азиатских популяциях нерки (0,00504 (s=0,000004)), чем в североамериканских (0,00403 (s=0,000002)). Нуклеотидные последовательности всех особей делятся на 2 группы. Особи данных группировок не имеют территориальной привязанности, т.е. отмечены как в азиатских, так и в американских популяциях. Наиболее вероятно, что указанные группировки сформировались в результате позднеплейстоценовых колебаний климата и связанных с этим наличие 2 рефугиумов на азиатском побережье - реки северного побережья Охотского моря и реки п-ва Камчатка. Для американских популяций нерки также предполагается существование в период похолодания климата двух рефугиумов, один в районе п-ва Аляски, второй в районе острова Ванкувер. Практически все крупные популяции нерки находятся под влиянием промысла и во многих случаях искусственного разведения. надежного различения заводской рыбы, разводимой на рыбоводных заводах, от нерки, воспроизводящейся в природных нерестилищах, можно использовать характерную нуклеотидную последовательность гена цитохромоксидазы мтДНК.
Цель: изучить полиморфизм генов STAT1, STAT5A у крупного рогатого скота голштинской породы, разводимого на Урале, для выявления перспективных геновариантов, ассоциированных с молочной продуктивностью.
Материалы и методы. Впервые в Уральском регионе проведены исследования по определению полиморфизма локусов генов семейства транскрипционных факторов STAT1 и STAT5A и изучению их взаимосвязи с признаками молочной продуктивности. Полиморфизм аллелей и их частоты определяли методом КАSP-генотипирования - конкурентная аллель-специфическая ПЦР.
Результаты. По локусу гена STAT1 генотипированы 92 головы, выявлены три геноварианта - СС (69,5 %), СТ (27,2 %) и ТТ (3,3 %). Продуктивность коров за 305 дней первой лактации составила: генотип СС - удой 8379 кг, жирномолочность 4,18 %, белковомолочность 3,23 %; генотип СТ - удой 8045 кг, МДЖ 4,17 %, МДБ 3,23 %; генотип ТТ - удой 7855 кг, МДЖ 4,16%, МДБ 3,18 %. Преимущество первотёлок с генотипом STAT1СС по удою составило 334-524 кг молока, по сравнению с аналогами из других групп. По локусу гена STAT5A определены генотипы у 90 голов крупного рогатого скота. Распространённым среди исследованного поголовья является генотип СТ (51,1 %), генотип СС встречался с частотой 25,6 %, генотип ТТ - с частотой 23,3 %. Молочная продуктивность в группе СС составила: удой 8376 кг молока, жирномолочность 4,19 %, белковомолочность - 3,21 %. Удой первотёлок в группах ТТ и СТ ниже на 83-142 кг, жирномолочность ниже на 0,02-0,03 %. По итогам проведенного исследования преимущество для использования в качестве маркеров высокой молочной продуктивности крупного рогатого скота голштинской породы имеет ген STAT1.
Цель: обобщить накопленный материал по исследованию микросателлитных локусов у европейского зубра (Bison bonasus), описанный в научной литературе, и провести их сравнительную характеристику.
Материалы и методы. База данных PubMed®/The National Center for Biotechnology Information (NCBI) (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/) и научная электронная библиотека eLIBRARY.RU (https://elibrary.ru/).
Результаты. Вопросу изучения генетического разнообразия популяций зубра посвящено множество работ, основанных на оценке родословных, а также на использовании ядерных и митохондриальных маркеров. Оценка генетического разнообразия и популяционной структуры, а также контроля степени инбридинга разводимых в неволе групп является одной из основных задач при сохранении и воспроизводстве редких видов. Это связано с тем, что в таких группах наблюдается снижение генетической изменчивости, которая влияет на адаптацию и выживание реинтрадуцированных на волю особей. Первые работы, посвященные изучению популяций зубров, проводились в 60-х годах XX века и были основаны на анализе групп крови. С открытием структуры ДНК и развитием методов определения ее вариабельности, на смену изучения белкового полиморфизма пришёл анализ самих нуклеотидных последовательностей ДНК. Широкое распространение в исследованиях генетической структуры европейского зубра получили микросателлиты, однонуклеотидные полиморфизмы ядерной и митохондриальной ДНК. Одним из важных критериев, предъявляемых к ДНК-маркерам, наряду с простотой использования и высокой воспроизводимостью, является, по возможности, снижение стоимости анализа и доступность для рутинного использования. В этой связи в нашем исследовании большее внимание мы уделили более рентабельному методу – анализу микросателлитных локусов. Всего для популяции европейского зубра было успешно амплифицировано 48 микросателлитных локусов. В основном использовались мультиплексные панели микросателлитных маркеров, разработанные для крупного рогатого скота (Bos taurus). При этом спектр и количество локусов в работах разных авторов не был одинаков. Исключение составил только локус BM1824, который был использован почти всеми научными коллективами. Число аллелей на локус варьировало от 1 до 6. Большинство рассмотренных локусов характеризуется низким количеством аллелей, что затрудняет оценку действительного показателя уровня инбридинга в популяциях зубра. В связи с этим необходимым является поиск новых, ранее неисследованных высокополиморфных локусов для оценки генетического разнообразия зубра, которые позволят не только более детально описать актуальное состояние генетического разнообразия, уровень геномного инбридинга, но и дать оценку степени дифференциации линий, а также помогут выявить наличие гибридизации с североамериканским бизоном (Bison bison bison) и крупным рогатым скотом (Bos taurus).
Издательство
- Издательство
- ВИЖ
- Регион
- Россия, Подольск
- Почтовый адрес
- 142132, Россия, Московская область, Городской округ Подольск, поселок Дубровицы, дом 60
- Юр. адрес
- 142132, Россия, Московская область, Городской округ Подольск, поселок Дубровицы, дом 60
- ФИО
- Зиновьева Наталия Анатольевна (Директор)
- E-mail адрес
- priemnaya-vij@mail.ru
- Контактный телефон
- +7 (496) 7651163
- Сайт
- https://www.vij.ru