Цель: анализ полиморфизма A/G в позиции 17:453356000 в гене TNS2, его ассоциации с фенотипическими показателями у радужной форели породы Рофор, а также исследование структуры размерно-весовых показателей исследуемой выборки.
Материалы и методы. Объект исследования – двухлетние самки радужной форели породы Рофор (n=200), от которых были получены морфометрические данные: масса тела, длина тела до конца хвостового плавника, длина тела до конца чешуйчатого покрова, длина головы, наибольшая высота и толщина тела. В исследовании применен метод генотипирования разработанной нами тест-системой и выполнена статистическая обработка данных в программной среде R с использованием библиотеки GGally и программной среде Python с инструментами анализа пакета scikit-learn.
Результаты. Успешно генотипированы самки маточного стада радужной форели породы Рофор (n=200) по замене A/G в позиции 17:453356000 гена TNS2. Подавляющее большинство особей оказалось носителем гетерозиготного генотипа AG (n=161). Проведённое исследование показало, что морфометрические признаки радужной форели имеют высокую взаимозависимость, а генотип GG ассоциируется с морфометрическими признаками, характеризующими более крупную конфигурацию тела у рыб. Настоящее исследование расширило имеющиеся знания в области генетики радужной форели. В результате проведения настоящего исследования была разработана тест-система для генотипирования замены A/G в экзонной части гена TNS2, которая может быть использована в программах маркер-ассоциированной селекции радужной форели.
Цель: поиск мононуклеотидных полиморфизмов гена-кандидата G0S2, участвующего в метаболизме липидов, и изучение их связи с содержанием абдоминального жира и массы тела у кур бройлеров.
Материалы и методы. В экспериментах использованы 150 бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» в возрасте 35 дней из частного фермерского хозяйства (2015 года). Для секвенирования использовались куры породы пушкинская (23 особи) в возрасте 475 дней, содержащихся на базе биоресурсной коллекции ВНИИГРЖ «Генетическая коллекция редких исчезающих пород кур» (г. Пушкин, Санкт-Петербург). Выявление мононуклеотидных полиморфизмов гена G0S2 проводилось методом секвенирования участков, содержащих кодирующие и регуляторные последовательности. Генотипирование методом амплификации для апробации тест систем проводилось на приборе Thermal Cycler T100 (Bio-Rad, США).
Результаты. С помощью секвенирования регуляторной области гена G0S2 выявлены два мононуклеотидных полиморфизма: rs29005090(A/ G) и rs317858728 (A/ G), а также достоверное (AG,AA,GG) замены rs29005090 на изучаемые признаки. Мононуклеотидная замена rs29005090 относится к мажорной, поскольку эффект замещения аллелей составляет более 0,6–1,5 сигмы. Генотип GG rs29005090 может быть рекомендован для селекции с помощью маркеров для увеличения привесов птицы и уменьшения абдоминального жира тушки курицы в мясном птицеводстве. При проведении дисперсионного анализа данных для расчета эффекта замещения аллелей маркера мононуклеотидной замены rs317858728 (A/ G) с признаками масса птицы и масса абдоминального жира бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» было выявлено достоверное различие между генотипами AA-GG для признака масса птицы и для признака масса абдоминального жира. Наибольшие показатели по массе тела и массе абдоминального жира наблюдались у кур с генотипом GG. Данная мононуклеотидная замена считается мажорной в отношении признака «абдоминальный жир», поскольку стандартное отклонение составляет более одной сигмы.