Цель: разработка новой модели дифференциации домашней свиньи и дикого кабана, основанной на анализе аутосомальных SNP, что позволяет повысить точность видовой идентификации. Материалы и методы. С использованием биоинформатических алгоритмов SRA-BLAST и GENIS проанализировано 1 639 геномов: 91 дикого кабана (Sus scrofa scrofa) и 1 548 домашней свиньи (Sus scrofa domesticus). Оценён дифференцирующий потенциал исследуемых полиморфизмов и рассчитана модель классификации дикого кабана и домашней свиньи на основе трёх SNP (Sscrofa11.1 (GCF_000003025.6)): rs330419406 (Chr.5:55839440A>G), rs81293059 (Chr.8:52261272C>T) и rs326780270 (Chr.1:265347265A>G, NR6A1). Заключение. Модель показала высокие значения точности (99,84 %), специфичности (100 %) и чувствительности (100 %). Проведена успешная апробация модели на выборке из 95 диких кабанов и 95 домашних свиней, точность классификации составила 100 %. В рамках апробации на материале ДНК дикого кабана и домашних свиней подтвержден высокий дифференцирующий потенциал предложенных полиморфизмов. Из 190 образцов корректно классифицированы 100 %. Поскольку генетическое сходство диких кабанов и домашних свиней достигает 99 %, для надёжной дифференциации их образцов необходимо применять специализированные методы и генетические маркеры, что подчеркивает особую значимость разработанной нами модели в контексте точных научных исследований.
Цель: анализ полиморфизма A/G в позиции 17:453356000 в гене TNS2, его ассоциации с фенотипическими показателями у радужной форели породы Рофор, а также исследование структуры размерно-весовых показателей исследуемой выборки.
Материалы и методы. Объект исследования – двухлетние самки радужной форели породы Рофор (n=200), от которых были получены морфометрические данные: масса тела, длина тела до конца хвостового плавника, длина тела до конца чешуйчатого покрова, длина головы, наибольшая высота и толщина тела. В исследовании применен метод генотипирования разработанной нами тест-системой и выполнена статистическая обработка данных в программной среде R с использованием библиотеки GGally и программной среде Python с инструментами анализа пакета scikit-learn.
Результаты. Успешно генотипированы самки маточного стада радужной форели породы Рофор (n=200) по замене A/G в позиции 17:453356000 гена TNS2. Подавляющее большинство особей оказалось носителем гетерозиготного генотипа AG (n=161). Проведённое исследование показало, что морфометрические признаки радужной форели имеют высокую взаимозависимость, а генотип GG ассоциируется с морфометрическими признаками, характеризующими более крупную конфигурацию тела у рыб. Настоящее исследование расширило имеющиеся знания в области генетики радужной форели. В результате проведения настоящего исследования была разработана тест-система для генотипирования замены A/G в экзонной части гена TNS2, которая может быть использована в программах маркер-ассоциированной селекции радужной форели.