Важным условием реализации функций, возложенных на органы государственной власти, является организация их регулярного взаимодействия между собой. Являясь в недавнем прошлом составной частью Министерства внутренних дел, отечественная пенитенциарная система, возглавляемая ныне Федеральной службой исполнения наказаний, и по сегодняшний день соединена с прежним ведомством крепкими связями. Вызванное практической необходимостью сотрудничество уголовно-исполнительной системы и полиции с каждым годом становится все теснее и многограннее. Результатом систематического взаимодействия между ведомствами стало достижение значительных результатов в противодействии преступлениям, совершаемым на территории пенитенциарных учреждений, в организации конвоирования осужденных и лиц, находящихся под стражей, в профилактике правонарушений среди лиц, состоящих на учете в уголовно-исполнительных инспекциях. Несмотря на достигнутые показатели, сохраняется потребность в расширении сотрудничества Министерства внутренних дел и Федеральной службы исполнения наказаний по таким направлениям, как профилактика правонарушений, организация силового сопровождения специальных мероприятий и противодействие экстремизму.