В данном исследовании представлены результаты анализа аллелофонда татарской породы лошадей в сравнении с аллелофондом якутской породой, полученные данные могут быть использованы при дальнейшей селекционной работе. Исследованиями установлено, что местные породы лошадей имеют широкий спектр аллелей по полиморфным белкам крови и высокий уровень генетического разнообразия. В изученных породах лошадей локус трансферрина детерминируется 5 аллелями: F, D, R, H, O, а локус альбумина оказался слабо полиморфным и представлен только двумя аллелями: А и В. В результате генетического анализа лошадей татарской и якутской пород было идентифицировано соответственно 15 генотипов из возможных 15 аллельных комбинаций. Наиболее частотным аллелем в обеих популяциях оказался аллель F, его частота у якутской породы лошадей достоверно превышала частоту татарских лошадей на 0,134 (р<0,05), что указывает о значимой дифференциации по данному локусу. В отличие, аллель O трансферрина был представлен минимально: у татарской породы лошадей составила 0,053, а у якутской – 0,030, что соответствует снижению в 1,77 раз. Данный аллель указывает на статистическую схожесть двух пород по данному полиморфизму. В полиморфных системах крови двух пород уровень полиморфности составил в среднем 2,441 и этот результат считается высоким для местных пород лошадей. Лошади татарской породы характеризуются высокой степенью гетерозиготности, которая в среднем составляет 0,597, что в сравнении с тем же показателем у якутской породы выше на 0,191. Следовательно, у татарской и якутской пород в локусах полиморфных белков крови четко прослеживаются определенные межпородные различия по частотам аллелей, степени гетерозиготности и числу эффективных аллелей, что указывает на определенную генетическую отдаленность изученных пород лошадей