Изучение врожденного иммунитета моллюсков необходимо для понимания эволюции иммунной системы и разработки стратегии борьбы с их паразитами.
В данной работе впервые получен и проанализирован транскриптом гемоцитов моллюсков Planorbarius corneus , зараженных в естественных условиях трематодой Bilharziella polonica (Schistosomatidae).
В сборках обнаружены транскрипты, кодирующие все основные группы факторов врождённого иммунитета. Наиболее многочисленной группой оказались молекулы распознавания патогенов.
На основе нуклеотидных последовательностей транскриптов предсказана доменная структура кодируемых ими белков.
Проанализирована структура доменов лектинов, толл-подобных рецепторов, молекул адгезии и токсинов. Показано большое разнообразие патоген-распознающих молекул гемоцитов P. corneus.
Полученные данные расширяют знания об иммунных реакцияхлегочных моллюсков на трематодную инвазию и дают возможность рассматривать роговую катушку как новый модельный организм для изучения их защитных реакций.
Идентификаторы и классификаторы
Изучение механизмов распознавания патогенов в системе врождённого иммунитета у животных разных таксонов является одним из ключевых направлений современной сравнительной иммунологии.
Согласно классическим представлениям, системы адаптивного и врождённого иммунитета различаются по способу распознавания чужеродного (Janeway, Medzhitov 2002).
Клетки системы адаптивного иммунитета обладают антиген-распознающими рецепторами, которые способны распознавать уникальные антигенные детерминанты. Эта особенность определяет специфичность иммунных реакций позвоночных животных.
Список литературы
-
Adema, C. M., Hertel, L. A., Miller, R. D., Loker, E. S. (1997) A family of fibrinogen-related proteins that precipitates parasite-derived molecules is produced by an invertebrate after infection. PNAS, vol. 94, no. 16, pp. 8691-8696. (In English). DOI: 10.1073/pnas.94.16.8691
-
Adema, C. M., Hillier, L. W., Jones, C. S. et al. (2017) Whole genome analysis of a schistosomiasistransmitting freshwater snail. Nature Communications, vol. 16, no. 8, article 15451. (In English). DOI: 10.1038/ncomms15451 EDN: YFFUWZ
-
Adema, C. M., Loker, E. S. (2015) Digenean-gastropod host associations inform on aspects of specific immunity in snails. Developmental and Comparative Immunology, vol. 48, no. 2, pp. 275-283. (In English). DOI: 10.1016/j.dci.2014.06.014
-
Allan, E. R. O., Yang, L., Tennessen, J. A., Blouin, M. S. (2019) Allelic variation in a single genomic region alters the hemolymph proteome in the snail Biomphalaria glabrata. Fish and Shellfish Immunology, vol. 88, pp. 301-307. (In English). DOI: 10.1016/j.fsi.2019.02.065
-
Angata, T., Brinkman-Van der Linden, E. C. M. (2002) I-type lectins. Biochim Biophys Acta, vol. 1572, no. 2-3, pp. 294-316. (In English). DOI: 10.1016/s0304-4165(02)00316-1 EDN: LUIVJZ
-
Ataev, G. L., Polevshchikov, A. V. (2004) Zashchitnye reaktsii bryukhonogikh mollyuskov. 1. Kletochnye reaktsii [Protective reactions of Gastropod molluscs. 1. Cell reactions]. Parazitologiya, vol. 38, no. 4, pp. 342-351. (In Russian). EDN: MXQRUQ
-
Ataev, G. L., Prokhorova, E. E., Kudryavtsev, I. V., Polevshchikov, A. V. (2016) The influence of trematode infection on the hemocyte composition in Planorbarius corneus (Gastropoda, Pulmonata). Invertebrate Survival Journal, vol. 13, no. 1, pp. 164-171. (In English). EDN: WWGJTV
-
Ataev, G. L., Prokhorova, E. E., Tokmakova, A. S. (2020) Zashchitnye reaktsii legochnykh mollyuskov pri parazitarnoj invazii [Defense reactions of pulmonate molluscs during parasitic invasion]. Parazitologiya, vol. 54, no. 5, pp. 371-401. (In Russian). DOI: 10.31857/S1234567806050028 EDN: QKIVOS
-
Berwin, B., Hart, J. P., Rice, S. et al. (2003) Scavenger receptor-A mediates gp96/GRP94 and calreticulin internalization by antigen-presenting cells. The EMBO Journal, vol. 22, no. 22, pp. 6127-6136. (In English). DOI: 10.1093/emboj/cdg572
-
Blanc, G., Font, B., Eichenberger, D. et al. (2007) Insights into how CUB domains can exert specific functions while sharing a common fold: conserved and specific features of the CUB1 domain contribute to the molecular basis of procollagen C-proteinase enhancer-1 activity. Journal of Biological Chemistry, vol. 282, no. 23, pp. 16924-16933. (In English). DOI: 10.1074/jbc.M701610200 EDN: MGIGKR -
Bowie, A., O'Neill, L. A. J. (2000) The interleukin-1 receptor/Toll-like receptor superfamily: signal generators for pro-inflammatory interleukins and microbial products. Journal of Leukocyte Biology, vol. 67, no. 4, pp. 508-514. (In English). DOI: 10.1002/jlb.67.4.508 -
Bridger, J. M., Brindley, P. J., Knight, M. (2018) The snail Biomphalaria glabrata as a model to interrogate the molecular basis of complex human diseases. PLoS Neglected Tropical Diseases, vol. 12, no. 8, article e0006552. (In English). DOI: 10.1371/journal.pntd.0006552 -
Brown, R., Soldánová, M., Barrett, J., Kostadinova, A. (2011) Small-scale to large-scale and back: larval trematodes in Lymnaea stagnalis and Planorbarius corneus in Central Europe. Parasitology Research, vol. 108, pp. 137-150. (In English). DOI: 10.1007/s00436-010-2047-z EDN: GGWJOW -
Chen, H., Cai, X., Li, R. et al. (2022) A novel toll-like receptor from Crassostrea gigas is involved in innate immune response to Vibrio alginolyticus. Infection, Genetics and Evolution, vol. 97, article 105159 (In English). DOI: 10.1016/j.meegid.2021.105159 -
Clemmensen, I., Petersen, L. C., Kluft, C. (1986) Purification and characterization of a novel, oligomeric, plasminogen kringle-4 binding protein from human plasma: tetranectin. European Journal of Biochemistry, vol. 156, no. 2, pp. 327-333. (In English). DOI: 10.1111/j.1432-1033.1986.tb09586.x -
Dheilly, N. M., Duval, D., Mouahid, G. et al. (2015) A family of variable immunoglobulin and lectin domain containing molecules in the snail Biomphalaria glabrata. Developmental and Comparative Immunology, vol. 48, no. 1, pp. 234-243. (In English). DOI: 10.1016/j.dci.2014.10.009 -
Donaghy, L., Hong, H.-K., Lambert, C. et al. (2010) First characterisation of the populations and immunerelated activities of hemocytes from two edible gastropod species, the disk abalone, Haliotis discus discus and the spiny top shell, Turbo cornutus. Fish & Shellfish Immunology, vol. 28, no. 1, pp. 87-97. (In English). DOI: 10.1016/j.fsi.2009.10.006 EDN: NAFJQV -
Du, Y., Shi, H., Guo, Q. et al. (2023) Hirudomacin: a Protein with Dual Effects of Direct Bacterial Inhibition and Regulation of Innate Immunity. Applied and Environmental Microbiology, vol. 89, no. 7, article e0052723. (In English). DOI: 10.1128/aem.00527-23 EDN: SAMFSN -
Faltýnková, A., Našincová, V., Kablásková, L. (2008) Larval trematodes (Digenea) of planorbid snails (Gastropoda: Pulmonata) in Central Europe: a survey of species and key to their identification. Systematic Parasitology, vol. 69, pp. 155-178. (In English). DOI: 10.1007/s11230-007-9127-1 EDN: MDTFOV -
Fraser, I. P., Koziel, H., Ezekowitz, R. A. B. (1998) The serum mannose-binding protein and the macrophage mannose receptor are pattern recognition molecules that link innate and adaptive immunity. Seminars in Immunology, vol. 10, no. 5, pp. 363-372. (In English). DOI: 10.1006/smim.1998.0141 -
Fu, L., Niu, B., Zhu, Z. et al. (2012) CD-HIT: accelerated for clustering the next-generation sequencing data. Bioinformatics, vol. 28, no. 23, pp. 3150-3152. (In English). DOI: 10.1093/bioinformatics/bts565 -
Galinier, R., Portela, J., Mone, Y. et al. (2013). Biomphalysin, a new β pore-forming toxin involved in Biomphalaria glabrata immune defense against Schistosoma mansoni. PLoS Pathogens, vol. 9, no. 3., article e1003216. (In English). DOI: 10.1371/journal.ppat.1003216 -
Gong, H., Kobayashi, K., Sugi, T. et al. (2012) A novel PAN/apple domain-containing protein from Toxoplasma gondii: characterization and receptor identification. PLoS One, vol. 7, no. 1, article e30169. (In English). DOI: 10.1371/journal.pone.0030169 -
Gordy, M. A., Pila, E. A., Hanington, P. C. (2015) The role of fibrinogen-related proteins in the gastropod immune response. Fish & Shellfish Immunology, vol. 46, no. 1, pp. 39-49. (In English). DOI: 10.1016/j.fsi.2015.03.005 EDN: UODXUJ -
Gough, P. J., Gordon, S. (2000) The role of scavenger receptors in the innate immune system. Microbes and Infections, vol. 2, no. 3, pp. 305-311. (In English). DOI: 10.1016/s1286-4579(00)00297-5 -
Grabherr, M. G., Haas, B. J., Yassour, M., Levin, J. Z. et al. (2011). Trinity: reconstructing a full-length transcriptome without a genome from RNA-Seq data. Nature biotechnology, vol. 29, pp. 644-652. (In English). DOI: 10.1038/nbt.1883 -
Graversen, J. H., Sigurskjold, B. W., Thøgersen, H. C., Etzerodt, M. (2000) Tetranectin-binding site on plasminogen kringle-4 involves the lysine-binding pocket and at least one additional amino acid residue. Biochemistry, vol. 39, no. 25, pp. 7414-7419. (In English). DOI: 10.1021/bi000155j -
Hall, T. A. (1999) BioEdit: A user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Symposium Series, vol. 41, no. 2, pp. 95-98. (In English). -
Hanington, P. C., Forys, M. A., Dragoo, J. W. et al. (2010a) Role for a somatically diversified lectin in the resistance of an invertebrate to parasite infection. PNAS, vol. 107, no. 49, pp. 21087-21092. (In English). DOI: 10.1073/pnas.1011242107 EDN: OLASQZ -
Hanington, P. C., Forys, M. A., Loker, E. S. (2012) A somatically diversified defense factor, FREP3, is a determinant of snail resistance to Schistosome infection. PLoS Neglected Tropical Diseases, vol. 6, no. 3, article e1591. (In English). DOI: 10.1371/journal.pntd.0001591 -
Hanington, P. C., Lun, C.-M., Adema, C. M., Loker, E. S. (2010b) Time series analysis of the transcriptional responses of Biomphalaria glabrata throughout the course of intramolluscan development of Schistosoma mansoni and Echinostoma paraensei.International Journal of Parasitology, vol. 40, no. 7, pp. 819-831. (In English). DOI: 10.1016/j.ijpara.2009.12.005 EDN: MYCQFF -
Hashimoto, C., Hudson, K. L., Anderson, K. V. (1988) The Toll gene of Drosophila, required for dorsalventral embryonic polarity, appears to encode a transmembrane protein. Cell, vol. 52, no. 2, pp. 269- 279. (In English). DOI: 10.1016/0092-8674(88)90516-8 -
Hernandez, J. D., Baum, L. G. (2002) Ah, sweet mystery of death! Galectins and control of cell fate. Glycobiology, vol. 12, no. 10, pp. 127R-136R. (In English). DOI: 10.1093/glycob/cwf081 EDN: XNXQMH -
Huang, M., Song, X., Zhao, J. et al (2013) A C-type lectin (AiCTL-3) from bay scallop Argopecten irradians with mannose/galactose binding ability to bind various bacteria. Gene, vol. 531, no. 1, pp. 31-38. (In English). DOI: 10.1016/j.gene.2013.08.042 -
Inohara, N., Nuñez, G. (2002) ML - a conserved domain involved in innate immunity and lipid metabolism. Trends in Biochemical Sciences, vol. 27, no. 5, pp. 219-221. (In English). DOI: 10.1016/s0968-0004(02)02084-4 EDN: AXXEWH -
Ittiprasert, W., Miller, A., Myers, J. et al. (2010) Identification of immediate response genes dominantly expressed in juvenile resistant and susceptible Biomphalaria glabrata snails upon exposure to Schistosoma mansoni. Molecular and biochemical parasitology, vol. 169, no. 1, pp. 27-39. https://doi.org/j.molbiopara.2009.09.009 (In English). EDN: MXVASF -
Janeway, C. A. Jr., Medzhitov, R. (2002). Innate immune recognition. Annual Review of Immunology, vol. 20, pp. 197-216. (In English). DOI: 10.1146/annurev.immunol.20.083001.084359 -
Jung, S., Sönnichsen, F. D., Hung, C.-W. et al. (2012) Macin family of antimicrobial proteins combines antimicrobial and nerve repair activities. Journal of Biological Chemistry, vol. 287, no. 17, pp. 14246- 14258. (In English). DOI: 10.1074/jbc.M111.336495 -
Kanzok, S. M., Hoa, N. T., Bonizzoni, M. et al. (2004) Origin of Toll-like receptor-mediated innate immunity. Journal of Molecular Evolution, vol. 58, pp. 442-448. (In English). DOI: 10.1007/s00239-003-2565-8 EDN: EBPYWV -
Kim, D., Langmead, B., Salzberg, S. L. (2015) HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements. Nature Methods, vol. 12, no. 4, pp. 357-360. (In English). DOI: 10.1038/nmeth.3317 -
Kim, J. Y., Kim, Y. M., Cho, S. K. et al. (2008) Noble tandem-repeat galectin of Manila clam Ruditapes philippinarum is induced upon infection with the protozoan parasite Perkinsus olseni. Developmental and comparative immunology, vol. 32, no. 10, pp. 1131-1141. (In English). DOI: 10.1016/j.dci.2008.03.002 -
Kohda, D., Morton, C. J., Parkar, A. A. et al. (1996) Solution structure of the link module: a hyaluronanbinding domain involved in extracellular matrix stability and cell migration. Cell, vol. 86, no. 5, pp. 767-775. (In English). DOI: 10.1016/s0092-8674(00)80151-8 -
Kokryakov, V. N. (2006) Ocherki o vrozhdennom immunitete [Essays on innate immunity]. Saint Petersburg: Nauka Publ., 261 p. (In Russian). -
Kron, N. S. (2022) In search of the Aplysia immunome: an in silico study. BMC Genomics, vol. 23, article 543. (In English). DOI: 10.1186/s12864-022-08780-6 -
Kumar, H., Kawai, T., Akira, S. (2011) Pathogen recognition by the innate immune system.International Reviews of Immunology, vol. 30, no. 1, pp. 16-34. (In English). DOI: 10.3109/08830185.2010.529976 -
Lemaitre, B., Nicolas, E., Michaut, L. et al. (1996) The dorsoventral regulatory gene cassette spätzle/ Toll/cactus controls the potent antifungal response in Drosophila adults. Cell, vol. 86, no. 6, pp. 973- 983. (In English). DOI: 10.1016/S0092-8674(00)80172-5 -
Letunic, I., Khedkar, S., Bork, P. (2021) SMART: recent updates, new developments and status in 2020. Nucleic Acids Research, vol. 49, no. D1, pp. D458-D460. (In English). DOI: 10.1093/nar/gkaa937 EDN: EKKVZL -
Li, H., Gharamah, A. A., Hambrook, J. R. et al. (2022) Single-cell RNA-seq profiling of individual Biomphalaria glabrata immune cells with a focus on immunologically relevant transcripts. Immunogenetics, vol. 74, pp. 77-98. (In English). DOI: 10.1007/s00251-021-01236-3 EDN: TMAOJQ -
Li, H., Hambrook, J. R., Pila, E. A. et al. (2020) Coordination of humoral immune factors dictates compatibility between Schistosoma mansoni and Biomphalaria glabrata. eLife, vol. 9, article e51708. (In English). DOI: 10.7554/eLife.51708 -
Liu, C., Jiang, S., Wang, M. et al. (2016) A novel siglec (CgSiglec-1) from the Pacific oyster (Crassostrea gigas) with broad recognition spectrum and inhibitory activity to apoptosis, phagocytosis and cytokine release. Developmental and Comparative Immunology, vol. 61, pp. 136-144. (In English). DOI: 10.1016/j.dci.2016.03.026 -
Liu, L., Yang, J., Qiu, L. et al. (2011) A novel scavenger receptor-cysteine-rich (SRCR) domain containing scavenger receptor identified from mollusk mediated PAMP recognition and binding. Developmental and Comparative Immunology, vol. 35, no. 2, pp. 227-239 (In English). DOI: 10.1016/j.dci.2010.09.010 EDN: OANXSL -
Loker, E. S., Adema, C. M., Zhang, S.-M., Kepler, T. (2004) Invertebrate immune systems - not homogeneous, not simple, not well understood. Immunological Reviews, vol. 198, no. 1, pp. 10-24. (In English). DOI: 10.1111/j.0105-2896.2004.0117.x EDN: XQDITZ -
Lu, L., Bu, L., Zhang, S.-M. et al. (2022) An Overview of Transcriptional Responses of SchistosomeSusceptible (M line) or -Resistant (BS-90) Biomphalaria glabrata Exposed or Not to Schistosoma mansoni Infection. Frontiers in Immunology, vol. 12, article 805882. (In English). DOI: 10.3389/fimmu.2021.805882 -
Lv, Z., Qiu, L., Wang, W. et al. (2020) The Members of the Highly Diverse Crassostrea gigas Integrin Family Cooperate for the Generation of Various Immune Responses. Frontiers in Immunology, vol. 11, article 1420. (In English). DOI: 10.3389/fimmu.2020.01420 -
Marcel, M. (2011) Cutadapt removes adapter sequences from high-throughput sequencing reads. EMBnet Journal, vol. 17, no. 1, pp. 10-12. (In English). DOI: 10.14806/ej.17.1.200 -
Moné, Y., Gourbal, B., Duval, D. et al. (2010) A large repertoire of parasite epitopes matched by a large repertoire of host immune receptors in an invertebrate host/parasite model. PLoS Neglected Tropical Diseases, vol. 4, no. 9, article e813. (In English). DOI: 10.1371/journal.pntd.0000813 EDN: ONENGT -
Murphy, J. E., Tedbury, P. R., Homer-Vanniasinkam, S. et al. (2005) Biochemistry and cell biology of mammalian scavenger receptors. Atherosclerosis, vol. 182, no. 1, pp. 1-15. (In English). DOI: 10.1016/j.atherosclerosis.2005.03.036 -
Natarajan, K., Mage, M. G., Margulies, D. H. (2015) Immunoglobulin Superfamily. [Online]. Available at: 10.1002/9780470015902.a0000926.pub2 (accessed 12.12.2023) (In English). DOI: 10.1002/9780470015902.a0000926.pub2(accessed12.12.2023) -
Oreste, U., Ametrano, A., Coscia, M. R. (2021) On Origin and Evolution of the Antibody Molecule. Biology, vol. 10, no. 2, article 140. (In English). DOI: 10.3390/biology10020140 EDN: IFLZIO -
Orlov, I. A., Ataev, G. L., Gourbal, B. et al. (2023) The transcriptomic analysis of Planorbarius corneus hemocytes (Gastropoda) naturally infected with Bilharziella polonica (Schistosomatidae). Developmental and Comparative Immunology, vol. 140, article 104607. (In English). DOI: 10.1016/j.dci.2022.104607 -
Patro, R., Duggal, G., Love, M. I. et al. (2017) Salmon provides fast and bias-aware quantification of transcript expression. Nature Methods, vol. 14, pp. 417-419. (In English). DOI: 10.1038/nmeth.4197 -
Peterson, N. A., Hokke, C. H., Deelder, A. M., Yoshino, T. P. (2009) Glycotope analysis in miracidia and primary sporocysts of Schistosoma mansoni: Differential expression during the miracidiumto-sporocyst transformation.International Journal for Parasitology, vol. 39, no. 12, pp. 1331-1344. (In English). DOI: 10.1016/j.ijpara.2009.06.002 -
Pila, E. A., Li, H., Hambrook, J. R. et al. (2017) Schistosomiasis from a Snail's Perspective: Advances in Snail Immunity. Trends in parasitology, vol. 33, no. 11, pp. 845-857. (In English). DOI: 10.1016/j.pt.2017.07.006 EDN: VCTHDG -
Pinaud, S., Portela, J., Duval, D. et al. (2016) A shift from cellular to humoral responses contributes to innate immune memory in the vector snail Biomphalaria glabrata. PLOS Pathogens. Vol. 12, no. 1, article e1005361. (In English). DOI: 10.1371/journal.ppat.1005361 -
Pinaud, S., Portet, A., Allienne, J.-F. et al. (2019) Molecular characterisation of immunological memory following homologous or heterologous challenges in the schistosomiasis vector snail, Biomphalaria glabrata. Developmental and Comparative Immunology, vol. 92, pp. 238-252. (In English). DOI: 10.1016/j.dci.2018.12.001 -
Portela, J., Duval, D., Rognon, A. et al. (2013) Evidence for specific genotype-dependent immune priming in the Lophotrochozoan Biomphalaria glabrata snail. Journal of Innate Immunity, vol. 5, no. 3, pp. 261-276. (In English). DOI: 10.1159/000345909 -
Prabhudas, M., Bowdish, D., Drickamer, K. et al. (2014) Standardizing scavenger receptor nomenclature. Journal of Immunology, vol. 192, no. 5, pp. 1997-2006. (In English). DOI: 10.4049/jimmunol.1490003 EDN: SOVPNX -
Ren, Y., Liu, H., Fu, S. et al. (2021) Transcriptome-wide identification and characterization of toll-like receptors response to Vibrio anguillarum infection in Manila clam (Ruditapes philippinarum). Fish & Shellfish Immunology, vol. 111, pp. 49-58. (In English). DOI: 10.1016/j.fsi.2021.01.007 EDN: XKPULC -
Saco, A., Novoa, B., Greco, S. et al. (2023) Bivalves Present the Largest and Most Diversified Repertoire of Toll-Like Receptors in the Animal Kingdom, Suggesting Broad-Spectrum Pathogen Recognition in Marine Waters. Molecular Biology and Evolution, vol. 40, no. 6, article msad133. (In English). DOI: 10.1093/molbev/msad133 EDN: UZVHAJ -
Schikorski, D., Cuvillier-Hot, V., Leippe, M. et al. (2008) Microbial challenge promotes the regenerative process of the injured central nervous system of the medicinal leech by inducing the synthesis of antimicrobial peptides in neurons and microglia. Journal of Immunology, vol. 181, no. 2, pp. 1083- 1095. (In English). DOI: 10.4049/jimmunol.181.2.1083 EDN: MLCVRB -
Schumacher, C., Wang, H., Honer, C. et al. (2000) The SCAN domain mediates selective oligomerization. The Journal of Biological Chemistry, vol. 275, no. 22, pp. 17173-17179. (In English). DOI: 10.1074/jbc.M000119200 -
Seppälä, O., Walser, J.-C., Cereghetti, T. et al. (2021) Transcriptome profiling of Lymnaea stagnalis (Gastropoda) for ecoimmunological research. BMC Genomics, vol. 22, article 144. (In English). DOI: 10.1186/s12864-021-07428-1 -
Seppey, M., Manni, M., Zdobnov, E. M. (2019). BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness. Methods in Molecular Biology, vol. 1962, pp. 227-245. (In English). DOI: 10.1007/978-1-4939-9173-0_14 -
Serebryakova, M. K., Tokmakova, A. S., Prokhorova, E. E., Ataev, G. L. (2022) Changes in the cell composition of the hemolymph in the snail Planorbarius corneus after infection with the trematode Plagiorchis sp. Invertebrate Biology, vol. 141, no. 4, article e12389. (In English). DOI: 10.1111/ivb.12389 EDN: BLPZGP -
Schultz, J. H., Bu, L., Adema, C, M. (2018) Comparative immunological study of the snail Physella acuta (Hygrophila, Pulmonata) reveals shared and unique aspects of gastropod immunobiology. Molecular Immunology, vol. 101, pp. 108-119. (In English). DOI: 10.1016/j.molimm.2018.05.029 -
Sivakamavalli, J., Park, K., Kwak, I.-S., Vaseeharan, B. (2021) Purification and partial characterization of carbohydrate-recognition protein C-type lectin from Hemifusus pugilinus. Carbohydrate Research, vol. 499, article 108224. (In English). DOI: 10.1016/j.carres.2020.108224 -
Sminia, T, van der Knaap, W. P. W. (1987) Cells and molecules in molluscan immunology. Developmental and Comparative Immunology, vol. 11, no. 1, pp. 17-28. (In English). DOI: 10.1016/0145-305x(87)90004-8 -
Smith-Unna, R., Boursnell, C., Patro, R. et al. (2016) TransRate: reference-free quality assessment of de novo transcriptome assemblies. Genome Research, vol. 26, no. 8, pp. 1134-1144. (In English). DOI: 10.1101/gr.196469.115 EDN: ULQHNM -
Tenner, A. J. (1998) C1q receptors: regulating specific functions of phagocytic cells. Immunobiology, vol. 199, no. 2, pp. 250-264. (In English). DOI: 10.1016/S0171-2985(98)80031-4 -
Tetreau, G., Pinaud, S., Portet, A. et al. (2017) Specific pathogen recognition by multiple innate immune sensors in an invertebrate. Frontiers In Immunology, vol. 8, article 1249. DOI: 10.3389/fimmu.2017.01249 -
Unno, H., Matsuyama, K., Tsuji, Y. et al. (2016) Identification, Characterization, and X-ray Crystallographic Analysis of a Novel Type of Mannose-Specific Lectin CGL1 from the Pacific Oyster Crassostrea gigas. Scientific reports, vol. 6, article 29135. (In English). DOI: 10.1038/srep29135 -
Van der Knaap, W. P. W. (1981) Recognition of foreignness in the internal defense system of the freshwater gastropod Lymnaea stagnalis. In: J. B. Solomon (ed.). Aspects of Developmental and Comparative Immunology. Proceedings of the 1st Congress of Developmental and Comparative Immunology, 27 July - 1 August 1980, Aberdeen. Aberdeen: Pergamon Press, pp. 91-97. (In English). DOI: 10.1016/B978-0-08-025922-2.50018-8 -
Varki, A., Cummings, R. D., Esko, J. D., et al. (eds.). (2022) Essentials of Glycobiology. 4th ed. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 859 p. PMID: 35536922 (In English). PMID: 35536922 -
Vasta, G. R., Ahmed. H. (eds.). (2008) Animal lectins. A functional view. Boca Raton: CRC Press, 596 p. (In English). DOI: 10.1201/9781420006971 -
Vogel, C., Teichmann, S. A., Chothia, C. (2003) The immunoglobulin superfamily in Drosophila melanogaster and Caenorhabditis elegans and the evolution of complexity. Development, vol. 130, no. 25, pp. 6317-6328. (In English). DOI: 10.1242/dev.00848 -
Wang, P., Zhang, Z., Xu, Z. et al. (2019) A novel invertebrate toll-like receptor with broad recognition spectrum from thick shell mussel Mytilus coruscus. Fish & Shellfish Immunology, vol. 89, pp. 132- 140. (In English). DOI: 10.1016/j.fsi.2019.03.059 -
Wang, W., Song, X., Wang, L., Song, L. (2018) Pathogen-Derived Carbohydrate Recognition in Molluscs Immune Defense.International Journal of Molecular Sciences, vol. 19, no. 3, article 721. (In English). DOI: 10.3390/ijms19030721 EDN: YHNZAD -
Watson, A., Agius, J., Ackerly, D. et al. (2022) The Role of Anti-Viral Effector Molecules in Mollusc Hemolymph. Biomolecules, vol. 12, no. 3, article 345. (In English). DOI: 10.3390/biom12030345 EDN: OSZNVU -
Worthley, D. L., Bardy, P. G., Mullighan, C. G. (2005) Mannose-binding lectin: biology and clinical implications.Internal Medicine Journal, vol. 35, no. 9, pp. 548-555. (In English). DOI: 10.1111/j.14455994.2005.00908.x -
Wu, R., Patocka, J., Nepovimova, E, et al.(2021) Marine Invertebrate Peptides: Antimicrobial Peptides. Frontiers In Microbiology, vol. 12, article 785085. (In English). DOI: 10.1016/10.3389/fmicb.2021.785085 -
Yoshino, T. P., Dinguirard, N., Kunert, J., Hokke, C. H. (2008) Molecular and functional characterization of a tandem-repeat galectin from the freshwater snail Biomphalaria glabrata, intermediate host of the human blood fluke Schistosoma mansoni. Gene, vol. 411, no. 1-2, pp. 46-58. (In English). DOI: 10.1016/j.gene.2008.01.003 -
Żbikowska, E. (2004) Infection of snails with bird schistosomes and the threat of swimmer's itch in selected Polish lakes. Parasitology Research, vol. 92, pp. 30-35. (In English). DOI: 10.1007/s00436-003-0997-0 EDN: EUSZYL -
Zelensky, A. N., Gready, J. E. (2005) The C-type lectin-like domain superfamily. FEBS Journal, vol. 272, pp. 6179-6217. (In English). DOI: 10.1111/j.1742-4658.2005.05031.x EDN: LTKPZJ -
Zhang, Q., Zmasek, C. M., Godzik, A. (2010) Domain architecture evolution of pattern-recognition receptors. Immunogenetics, vol. 62, no. 5, pp. 263-272. PMID: 20195594 (In English). EDN: NZIIOB PMID: 20195594 -
Zhang, S.-M., Zeng, Y., Loker, E. S. (2008) Expression profiling and binding properties of fibrinogenrelated proteins (FREPs), plasma proteins from the schistosome snail host Biomphalaria glabrata. Innate Immunity, vol. 14, no. 3, pp. 175-189. (In English). DOI: 10.1177/1753425908093800 -
Zhao, Q. P., Gao, Q., Zhang, Y. et al. (2018) Identification of Toll-like receptor family members in Oncomelania hupensis and their role in defense against Schistosoma japonicum. Acta Tropica, vol. 181, pp. 69-78. (In English). DOI: 10.1016/j.actatropica.2018.01.008
Выпуск
Другие статьи выпуска
В основу статьи положены материалы, собранные авторами в 2018-2022 гг. в заливе Счастья Охотского моря и в Николаевском районе Хабаровского края. В статье представлены новые данные по распространению, численности, особенностям биологии 57 видов птиц, среди которых 19 внесены в Красную книгу России, 22 - в Красную книгу Хабаровского края.
Впервые для залива Счастья отмечены залеты 11 видов птиц. Отмечены новые для Хабаровского края виды - морской зуек, полярная крачка и шелковистый скворец.
Документально зафиксировано вселение на залив Счастья монгольской, тихоокеанской, чернохвостой чаек и малой крачки. Констатируется необходимость расширения площади имеющихся на заливе особо охраняемых природных территорий (ООПТ) для сохранения ключевой орнитологической территории всемирного значения.
В статье кратко описаны районы, объекты, цели, методы и результаты зоологических и смежных исследований, проведенных во Всесоюзном институте защиты растений (ВИЗР) в 1946-1990 гг. С образованием в 1946 г. лаборатории прогнозов размножения массовых вредителей сельскохозяйственных культур зоологические исследования сосредоточились именно в этой лаборатории. Перечислены группы, руководители и ведущие сотрудники групп, созданных в это время по разным направлениям прикладной зоологии и защиты растений.
В работе приводится аннотированный список жуков надсемейства Cantharoidea Тюменской области (включая Ханты- Мансийский и Ямало-Ненецкий автономные округа). В настоящее время фауна Cantharoidea региона представлена 41 видом из 15 родов, 6 подсемейств и 3 семейств (Lycidae - 6, Lampyridae - 1 и Cantharidae - 34). В южной части региона зарегистрировано 35 видов из трех семейств, в Ханты-Мансийском АО - 24 вида (два семейства) и Ямало-Ненецком АО - 11 видов (два семейства). Впервые для области указано семь видов, из них Malthodes fibulatus Kiesenwetter, 1852 впервые приводится для фауны Сибири.
ГИЛЬДЕНКОВ МИХАИЛ ЮРЬЕВИЧПо материалам с Камчатки указывается Oxytelus ( Tanycraerus ) jessoensis Bernhauer, 1907. Проиллюстрирован хабитус, эдеагус и VIII стернит самца. Приводятся и проиллюстрированы отличия O . jessoensis от близких видов: Oxytelus ( Tanycraerus ) laqueatus (Marsham, 1802); Oxytelus ( Tanycraerus ) assingi Schülke, 2012 and Oxytelus ( Tanycraerus ) ruthenus Semionenkov & Gildenkov, 2022. Oxytelus jessoensis отличается от O. assingi более светлой окраской основания антенн (1-4 членики) и ротовых органов. Вид хорошо отличается от O. assingi иO. ruthenus строением VIII стернита брюшка самца и парамер эдеагуса.
Приводится иллюстрированное описание двух новых для науки видов свободноживущих нематод рода Thalassironus de Man, 1889 с коралловых рифов во Вьетнаме. Th. coralis sp. nov. близок к видам Th. bipartitus (Wieser, 1955) и Th. bohaensis Zhang, 1990. Отличается от обоих более тонким телом, более длинными внешними губными щетинками и более короткими спикулами. Th. longicaudatus sp. nov. морфологически ближе всего к Th. bipartitus (Wieser, 1955) и отличается от него более тонким телом, более длинными внешними головными щетинками, более короткой стомой и отсутствием преклоакальной щетинки у самцов.
Представлены первые сведения о структуре, биомассе и плотности беспозвоночных донных сообществ ненарушенных природных водотоков заповедника «Комсомольский», протекающих в зоне хвойно- широколиственного леса.
Выявлено 334 таксона из 31 систематической группы организмов. Средние показатели плотности бентоса составили 7719 экз./м2, биомассы - 12,8 г/м2. Доминантами являлись Chironomidae и Ephemeroptera по плотности, Gammarus sp. и Mollusca по биомассе.
Весной, относительно летнего периода, отмечались низкие значения плотности и биомассы водных беспозвоночных в реках и ручьях в 4,4 и 2,8 раза соответственно.
В эпиритрали малой реки максимальной плотности достигали «измельчители», которыми являются Gammarus sp. и многие представители отрядов Plecoptera и Trichoptera, а в метаритрали и гипоритрали плотность «измельчителей» снижалась.
Современное экологическое состояние водотоков по составу зообентоса оценивалось как хорошее.
В результате исследования на поверхностях тела и в физиологических жидкостях H. vigintioctomaculata были обнаружены микроконидии и макроконидии грибов рода Fusarium .
На челюстях насекомых наблюдалось большое количество гиф, много микроконидий, небольшое количество макроконидий (0.4-0.9%); в экскрементах - гифы и микроконидии; на ногах - гифы, микроконидии и до 20% макроконидий.
Отрыжка содержала 4.6% микроконидий и до 95.4% макроконидий. Самое большое количество макроконидий (30%) с одной, тремя и четырьмя перетяжками наблюдалось в кишечнике. Установлено, что конидии Fusarium spp. сохраняют контагиозность после прохождения пищеварительного тракта картофельной коровки.
Максимальный балл повреждения на 14-е сутки после заражения наблюдался на растениях, зараженных содержимым отрыжки и кишечника (96 и 90% развития болезни соответственно), наименьший - для инфицированных содержимым экскрементов (64% развития болезни).
Полученные данные свидетельствуют о возможности распространения фузарий в агробиоценозе картофельного поля посредством питания и миграции H. vigintioctomaculata
В 2023 г. в долине реки Мельгуновка (река Криничная, Хорольский район, Приморский край) обнаружен реликт дравида Ганина Drawida ganini Zhang and Wu, 2021. Это третья находка вида в Приморском крае. Стенобионтность (вид обитает в торфяных и торфяно-глеевых почвах переувлажненных и заболоченных лугов) и малоподвижностьD. ganini позволяют рассматривать этот вид в качестве маркера плейстоценовых рефугиумов, сохранявших тепло- и влаголюбивые фаунистические элементы в речных поймах пространств юга Дальнего Востока России и прилегающей территории Северо-Восточного Китая.
Данное исследование проведено для определения возможности использования линных перьев и скорлупы яиц в качестве биоиндикаторов для оценки уровня накопления микроэлементов в организме редких птиц.
С этой целью были определены концентрации элементов, в том числе токсичных тяжелых металлов, в биологических образцах дальневосточного аиста из районов гнездования в Хабаровском крае на особо охраняемых природных территориях: в государственном природном заповеднике «Болоньский» и природном парке«Шереметьевский» в бассейне р. Амур. Оценка содержания поллютантов в очинах и опахале линных перьев и в скорлупе яиц аистов проводилась методом масс-спектрометрии с индуктивно связанной плазмой на приборе ICP-MS Elan 9000.
Выявлено, что анализ состава очинов линных перьев и скорлупы яиц позволяет оценивать уровень депонирования микроэлементов из пищевых цепей, что характеризует данный неинвазивный метод биоиндикации как перспективный для экологического мониторинга редких птиц.
В статье впервые для острова Сахалин отмечаются Episinus affinis Bösenberg & Strand, 1906, Phoroncidia pilula (Karsch, 1879), Steatoda grossa (C. L. Koch, 1838). Они известны с сопредельных с Сахалином территорий, однако для самого острова виды не указывались.
Подтверждено обитание на Сахалине Steatoda albomaculata (De Geer, 1778), вид впервые приводится для южной части острова. Обсуждается распространениеE. affinis, Ph. pilula, S. albomaculata, S. grossa, а также видовой состав других представителей семейства Theridiidae на островах Сахалин и Монерон. Даны главные определительные признаки видов. Приведены фотографии внешнего вида пауков, эпигины самок и пальпы самцов.
В статье приведены краткие сведения о местах и обстоятельствах встречи шести редких и охраняемых видов птиц (касатка, даурский журавль, большой погоныш, дальневосточный кроншнеп, сибирская пестрогрудка и дубровник), зарегистрированных в ходе краткосрочных экспедиционных исследований в окрестностях г.
Свободный в конце мая - начале июня 2022 и 2023 гг. Изложенные сведения могут представлять интерес для специалистов в области природоохранной деятельности, принимающих участие в ведении Красной книги Амурской области.
Стрессор - любое достаточно сильное воздействие на организм: жара, холод, голод, интоксикация и т. д. Гормоны стресса оказывают определенный физиологический эффект на организм насекомого.
Выявлено, что воздействие стрессоров приводит к повышению уровня гормонов стресса (мг% адреналина) у личинок Henosepilachna vigintioctomaculata .
При питании на сорте картофеля Belmonda, а также термическом воздействии (укол раскаленной иглой) выявлено резкое повышение уровня гормонов стресса у фитофага (мг% адреналина) относительно контроля, составившего 14,9 ± 1,21 и 14,53 ± 1,25 соответственно.
При развитии микозов ( Beauveria bassiana ) и бактериозов ( Bacillus thuringiensis) у картофельной коровки уровень гормонов стресса (мг% адреналина) в теле личинок плавно нарастает и поддерживается на стабильно высоком уровне по мере протекания патогенеза.
Чайка Кумлиена - подвид полярной чайки Larus glaucoides kumlieni Brewster, 1883, гнездящийся в основном в южной части о. Баффинова Земля и зимующий на северо-востоке Канады и США. В Азии эту чайку регистрировали на зимовке в Японии и Южной Корее, но не было ни одной достоверной находки ее на территории России.
В данном сообщении приводится информация о первом документированном наблюдении чайки Кумлиена в северо-восточной части Охотского моря, где 2 марта 2020 г. сфотографировали взрослую особь в зимнем наряде в координатах 57°03′00″N, 153°23′10″E в 170 км от побережья Западной Камчатки.
Анализ описательных диагностических признаков в сравнении с близкородственными формами glaucoides и thayeri показал, что все они соответствуют L. g. kumlieni . Достоверность идентификации подтверждена Фаунистической комиссией при Мензбировском орнитологическом обществе.
Приводятся данные о возрастной структуре и половом диморфизме дальневосточной жабы, Bufo sachalinensis Nikolsky, 1905 на территории Уссурийского государственного природного заповедника. Всего были изучены препараты от 53 животных (22 самок и 31 самца).
Возраст изученных самок колебался от 4 до 7 лет, в среднем 5,2±0,97, самцов - от 2 до 6 лет, в среднем 3,9±1,00. Средняя длина тела самок статистически значимо превосходила длину самцов.
Отмечается наличие дополнительных линий склеивания, соответствующих периодам задержки роста в летний период. Мы не выявили положительной корреляции между возрастом и размерами тела.
В статье приводится новая находка Phytometra amata (Butler, 1879) из Алтайского края. Вид впервые указывается для фауны Западной Сибири, для Русского Алтая и Предалтайского региона Каталога чешуекрылых России. Граница сибирской части ареала вида расширена почти на 500 км на юго-запад.
Приводится список совкообразных чешуекрылых (Noctuoidea), встреченных в месте поимки Phytometra amata . Рассматриваются биотопические предпочтения имаго и вероятные трофические связи гусениц Phytometra amata в Алтайском крае.
Исследована изменчивость участка гена цитохрома b ( cyt b ) митохондриальной ДНК длиной 744 пары нуклеотидов 13 образцов восточноазиатских мышей Apodemus peninsulae из популяции Национального парка «Земля леопарда» на юге Приморского края.
Показано присутствие двух филогенетических линий в этой популяции:«Amur» и «Korea». При этом линия «Korea» была обнаружена для Дальнего Востока России впервые. Обсуждается вопрос согласованности эволюции хантавируса AMRV и его природного носителя - восточноазиатской мыши.
Сведения о трематодах рыб Мингечевирского водохранилища практически отсутствовали. Паразитологические исследования 341 экз. рыб, относящихся к 25 видам, проведенные в 2016-2022 гг. в этом водоеме выявили 26 видов трематод.
Из них 9 видов завершают свое развитие в рыбах, а 17 видов - в рыбоядных птицах. Отмечена зависимость фауны трематод различных трофических групп рыб от состава их пищи.
Фауна трематод рыб была богаче на участках, расположенных у устьев рек, впадающих в водохранилище, а также в меньшей степени на участке у места выхода реки Куры из водохранилища.
На участках, расположенных далеко от этих мест, фауна трематод сильно обеднена. Среди всех отмеченных трематод восемь видов являются возбудителями болезней рыб, а один вид опасен для человека.
Тарбаган, или монгольский сурок Юго-Восточного Забайкалья внесен в Красную книгу России. В 2012-2023 гг. проводились ежегодные учёты этого вида на двух федеральных особо охраняемых природных территориях: в Даурском заповеднике и в заказнике «Долина дзерена», расположенных в России вдоль границы с Монголией и Китаем.
В начале 2023 года численность сурков составляла около 3110 семей в заказнике и около 310 семей в Даурском заповеднике (вместе с охранной зоной). Отмечено, что скорость восстановления численности в отдельных колониях после ее снижения может достигать 26% в год, но при освоении новой территории рост численности популяции составил всего около 12% в год.
Низкая скорость роста популяции по сравнению с потенциально возможной может быть связана с высоким уровнем смертности от хищников и низким реализованным уровнем воспроизводства.
Общая численность тарбагана на двух рассматриваемых особо охраняемых природных территориях весной 2023 г. составляла примерно 9.6 тыс. особей, что сопоставимо с оценкой численности вида в Юго-Восточном Забайкалье в целом по состоянию на 2017-2018 гг.
Согласно современным данным, в фауне заповедника «Большехехцирский» выявлено 54 вида млекопитающих из 18 семейств и 6 отрядов, в числе которых обитание двухцветного кожана, уссурийского трубконоса, пятнистого оленя и канадского бобра в заповеднике установлено в последние десятилетия.
Наименее изученной остается фауна рукокрылых. Наблюдениями, в том числе при помощи фотоловушек, подтверждено обитание харзы и кабарги, длительное время не отмечаемых на этой особо охраняемой природной территории; получены новые сведения о пребывании в заповеднике обыкновенной куторы, уссурийской белозубки, сибирского ушана, длиннохвостой мышовки, амурского тигра и амурского лесного кота; ставится вопрос об исключении солонгоя из списка териофауны заповедника.
Издательство
- Издательство
- РГПУ им. А. И. Герцена
- Регион
- Россия, Санкт-Петербург
- Почтовый адрес
- 191186, Санкт-Петербург, набережная реки Мойки 48
- Юр. адрес
- 191186, Санкт-Петербург, набережная реки Мойки 48
- ФИО
- Тарасов Сергей Валентинович (ректор)
- E-mail адрес
- mail@herzen.spb.ru
- Контактный телефон
- +7 (812) 3124477